Осенью 1347 года в Александрию прибыл корабль из Константинополя, на котором из 32 купцов и 300 человек корабельной команды и рабов в живых сумели остаться лишь 40 моряков, 4 купца и один раб, «каковые умерли тут же в порту». Поскольку они сошли на берег, то занесли и чуму. Далее она стала распространяться по Нилу и достигла Асуана в феврале 1349 года, за это время опустошив страну. Дальше на юг чума не продвинулась, поскольку ни крысы, ни блохи не смогли преодолеть Сахару.
Зато страны Средиземноморья ничем не были защищены. Моровое поветрие распространилось на Грецию и далее на Болгарию и Западную Румынию (в те времена бывшую частью Венгерского королевства) вплоть до Польши, накрыло Кипр, где к эпидемии прибавилось еще и цунами.
В октябре 1347 года в порт Мессины прибыли 12 генуэзских галер, привезших с собой и чуму. Правда, в разных источниках упоминаются и другие цифры – 3 или 4 корабля со специями, шедших из Крыма. Число не важно, важно то, к чему это привело.
Сицилийский историк Микеле де Пьяцца писал: «трупы оставались лежать в домах, и ни один священник, ни один родственник – сын ли, отец ли, кто-либо из близких – не решались войти туда: могильщикам сулили большие деньги, чтобы те вынесли и похоронили мертвых. Дома умерших стояли незапертыми со всеми сокровищами, деньгами и драгоценностями; если кто-либо желал войти туда, никто не преграждал ему путь». Очень быстро генуэзцев заставили покинуть город, но было уже поздно.
Население гибнущей Мессины пыталось спастись паническим бегством, разнося чуму во все места, куда попадали. Выжившие достигли Катании, где местные жители отказывались их принимать, требуя покинуть город. Поздно. Эпидемия в самом скором времени убила почти всех жителей. Чума отсюда продолжала распространяться по острову, сильно пострадали Сиракузы, Шакка, Агридженто. Город Трапани буквально обезлюдел. Одной из последних жертв эпидемии стал Джованни, герцог Рандаццо, Афин и Неопатрии с 1338 года, граф Мальты, регент Сицилии с 1342 года, сын короля Сицилии Федериго II. Герцог закрылся в своем замке Сент-Андреа, но это не помогло. Всего Сицилия потеряла около трети населения; эпидемия продолжалась год.
В октябре 1347 года изгнанные из Мессины генуэзские корабли попытались вернуться домой, но уже прослышавшие об опасности жители Генуи с помощью зажженных стрел и катапульт выгнали их в море. Таким образом Генуе удалось оттянуть начало эпидемии на два месяца.
В начале ноября уже около 20 зачумленных кораблей плавали по Средиземноморью и Адриатике, распространяя болезнь во всех портах, где хотя бы ненадолго бросали якорь. Часть генуэзской эскадры нашла приют в Марселе, но когда там начали заболевать люди, их изгнали, и они умерли в море. Марсель потерял едва ли не половину населения.