Памятники архитектуры создадут общий колорит экспозиции. Они послужат естественным фоном и для предметов материальной культуры, и для мемориального раздела музея. В общую композицию вольются археологические находки.
Будущая экспозиция расскажет о героике прошлых лет, о развитии и национальных особенностях русской фортификационной техники, об исторической роли крепости в защите границ Русского государства. Одной из главных тем явится борьба народа за свободу в период нарастания революционного движения накануне Великой Октябрьской революции.
Экспозиция раннего, новгородского, периода будет представлена фрагментами первоначальных стен и ворот, венцов изб и извлеченных из почвы многочисленных предметов быта.
О московском периоде истории крепости поведают крепостные стены и башни, снискавшие Орешку известность неприступной крепости и военно-морской базы.
К сожалению, не удастся воссоздать палат Петра I, хотя следы их найдены в раскопе. Зато бастионы будут демонстрироваться в прежнем виде. Вновь предстанут перед посетителями острова казармы с галереей и каналом у их стен.
О штурме крепости войсками Петра I экскурсоводы будут рассказывать у раскрытого основания разрушенной Подвальной башни. У исторического пролома, через который ворвались в крепость герои штурма 1702 года, грунт будет снят до прежнего уровня. Посетители будут иметь возможность осмотреть и памятник-курган, насыпанный в честь русских воинов, погибших при взятии Нотебурга.
Посетители смогут ознакомиться и с постройками тюремного периода истории крепости. Так называемый Секретный дом, заложенный во дворе цитадели в конце XVIII века, войдет в экспозицию как бывшая тюрьма декабристов.
Построенный в XIX веке так называемый народовольческий корпус с 40 одиночными камерами представит следующий этап в истории крепости-тюрьмы. В начале XX века на месте бывшего Комендантского дома построен вместительный корпус каторжного централа. Предполагается восстановить и это здание. Заканчивается реставрация здания Секретного дома в цитадели, подготовлены к восстановлению петровские казармы.
Об обороне Шлиссельбурга во время Великой Отечественной войны красноречиво расскажет южная часть острова, которая подвергалась наибольшему разрушению вражеской артиллерией. Там раскинется площадь, где предполагается создать монумент советским воинам-героям.
Впоследствии в экскурсионный маршрут войдет и осмотр Колокольной башни. С высоты ее верхней площадки экскурсанты смогут любоваться широкими просторами Ладоги и живописным видом берегов Невы.