На рассмотрение упомянутой ранее комиссии по выбору места базирования Балтийского флота наряду со Свеаборгом предлагались Моонзундский пролив в Эстонии и порт Либава на побережье Латвии. 7 ноября 1887 г. в Петербурге под руководством военного министра П.С. Ванновского состоялось совещание, на котором был обсужден этот вопрос. Участвовали морской министр адмирал И.А. Шестаков, его заместитель контр-адмирал Н.М. Чихачев, представители Военного министерства Н.Н. Обручев и генерал-лейтенант Г.И. Бобриков>{266}, а также несколько экспертов. На совещании было принято решение изучить вопрос о пригодности Моонзундского пролива для размещения Балтийского флота. Руководить этими работами был назначен Бобриков. Ознакомившись с обстановкой на местах, Бобриков, будучи сторонником стратегии активной обороны, высказался в пользу Моонзунда, Либавы и Виндавы. Однако два последних места легко блокировались с моря, и там не имело смысла строить крепостные сооружения против мощных кораблей противника. Поэтому предложения Бобрикова не получили поддержки, и в конце 1887 г. было созвано совещание для рассмотрения вопроса о Моонзунде в качестве места базирования Балтийского флота.
Мнения участников совещания вновь разошлись, и решение не было принято. В этой связи вопрос оставили открытым, сделав его частью плана обороны западных территорий России, составленного комиссией под руководством Обручева в 1885 г. Обновленная версия этого плана была доложена военному министру в 1887 г. В нем предлагалось сосредоточить основные силы России вблизи границы, где предполагалось построить мощные крепости Ковно и Осовец. Это ослабило бы оборону южного побережья Балтийского моря. У Либавы и Моонзунда были как сторонники, так и противники. Порт Либава имел важное торговое значение, но обеспечить его оборону было трудно. Моонзундский архипелаг располагался на стратегически важном месте, но строительство там крепостных укреплений требовало времени и значительных средств. Летом 1888 г. на островах Моонзундского архипелага начались работы по изучению местности на предмет ее пригодности для размещения флота, однако из-за противоречий среди флотских чинов строительство крепости не было начато>{267}.
В свою очередь, в Петербурге Финский залив считали важным районом базирования и оперативной зоной Балтийского флота. Работавшая в 1888–1890 гг. комиссия по вопросам береговой обороны рассматривала Балтийское море как фланг сухопутного фронта, оборона которого обеспечила бы защиту побережья Балтики и Финляндии и не позволила бы противнику прорваться к столице. Она поддержала предложения комиссии Обручева об усилении обороны побережья Финского залива