Российские адмиралы проявляли обеспокоенность в связи с происходившим в это же время усилением Балтийского флота Германии. Реакцией на это явилось дополнение к Программе 1898, ставшее своего рода ответом на укрепление немецкого флота на Балтике. На его реализацию отводилось двадцать лет. Программа кораблестроения была дополнена программой береговой обороны. На побережье были выбраны стратегически важные территории. План действий, принятый в 1903 г., определил задачей флота предотвращение высадки войск противника. Наиболее вероятными местами таких действий считались побережья у Виндавы, Рижского и Финского заливов. С учетом превосходства германского флота российскому флоту было предписано избегать сражений в открытом море и сосредоточиться на обороне побережья. В Финском заливе планировалось также организовать оборону с участием мобильных минных заградителей. Всего предполагалось сформировать четыре флотилии, по десять минных заградителей в каждой. Свеаборг был выбран в качестве основного места базирования и опорного пункта для этих кораблей. Организовать оборону Либавы от атак мощного флота противника представлялась сложным делом, поэтому было решено сосредоточить Балтийский флот вблизи Гельсингфорса и Ревеля>{310}.
Политика развития флота отразилась и на организации береговой обороны. В Генеральном штабе был создан отдел крепостей, в подчинение которому все крепости страны были переданы распоряжением 15 сентября 1901 г. В нем подробно были определены иерархия крепостей, их задачи, полномочия офицеров, обязанности рядового состава и административное деление. Была введена следующая градация береговых крепостей:
1-й класс — Кронштадт и Владивосток
2-й класс — Свеаборг и Севастополь
3-й класс — Выборг, Усть-Двинск, Батум
Градация крепостей определялась их стратегическим положением, и чем выше было место крепости в этой системе, тем выгоднее было ее положение при модернизации вооружений и другого оснащения, а также возможности обучения и подготовки личного состава. Это разделение сохранилось без изменений до начала Первой мировой войны. Построенные в начале века вокруг Петербурга морские форты, такие как «Ино», «Красная Горка» и «Петр Великий», не были включены в этот список>{311}.
С 1864 г. Свеаборг находился в подчинении Финляндского военного округа и его командующего — генерал-губернатора. Но в связи с упразднением по инициативе Бобрикова Финляндского военного округа с 10 августа 1904 г. Свеаборг перешел в подчинение Петербургского военного округа. С тех пор все решения стратегического характера, касающиеся Свеаборга, принимались в Петербурге, а комендант крепости подчинялся командованию Петербургского округа. Новое время потребовало и административных перемен. Было решено разделить управление морской обороной от береговой обороны. До этого командующий портом Свеаборга находился в подчинении у коменданта крепости. Теперь эта должность упразднялась и местом нахождения коменданта порта стал мыс Катаянокка