В марте 1952 года старший лейтенант розыскного отдела Главного управления органов военной контрразведки принял в производство 50 розыскных дел, в том числе дело за № 1184. Оно было заведено по розыску агента американской разведки и изменника Родине бывшего командующего 28-й армией, героя Гражданской войны, участника многих боевых операций по борьбе с басмачами, многократно раненного в боях генерал-лейтенанта, лишенного этого звания по суду, Качалова Владимира Яковлевича.
Контрразведчик обнаружил в архиве МО СССР документ командования 9-го армейского корпуса «Обзор военных действий за август 1941 года, в котором сообщалось о гибели в бою командующего 28-й армией Качалова. В этом архиве также имелась полученная по специальным каналам немецкая газета «Мюнхише Беобахтер», корреспондент которой присутствовал при захоронении Качалова.
Чего все они боялись? Было бы ошибкой полагать, что Сталин возмутился бы попыткой опротестовать приказ, где стоит его подпись. Отнюдь нет! Верховный строго бы спросил их за то, что столько лет все они, генералы министерства обороны и военной прокуратуры, его обманывали.
До того, как наступит следствие, верят в другие причины, чем после его наступления.
Фридрих Ницше
Первопричиной гонения на В. С. Абакумова было письмо-пасквиль, подписанное следователем по особо важным делам Следственной части МГБ СССР подполковником Рюминым, составленное не без помощи интриганов Маленкова и Хрущева и адресованное Сталину. В письме Рюмина говорилось:
«Считаю своим долгом сообщить Вам, что товарищ Абакумов, по моим наблюдениям, имеет наклонность обманывать правительственные органы путем замалчивания серьезных недочетов в работе органов МГБ…
Тов. Абакумов не всегда честными путями укреплял свое положение в государственном аппарате, и он является опасным человеком для государства».
Судьба Виктора Семеновича Абакумова решалась в ночь на 5 июля 1951 года в кремлевском кабинете Сталина. В половине первого ночи в кабинет к вождю зашли Берия, Маленков, Молотов и Булганин. Через тридцать минут вызвали на беседу ожидавшего в приемной министра государственной безопасности Абакумова. Вопросы задавал Сталин. Абакумов отвечал честно и четко — не «плавал», понимая, что эта встреча в таком составе началась неожиданно, как всякая неприятность.
Примерно через полчаса двери сталинского кабинета открылись, и в проеме показалась сконфуженная физиономия подполковника. Это был Рюмин. Так Сталин как заправский дознаватель устроил очную ставку между начальником и подчиненным. Министр гневно опровергал все обвинения. Маленков суетился, пытаясь включиться в процесс, но Сталин его одернул, мол, я тут главный следователь. Естественно, он никаких оправданий со стороны Виктора Семеновича не принял и, повернувшись в сторону подполковника, которого видел первый раз, сверкнув очами, в которых плавали сполохи гнева, почему-то тихо проговорил: