Письмо было рассмотрено в ВЧК на заседании ВЦИК 25 октября 1918 г. ВЦИК издал постановление по данной статье, в которой в частности говорилось: «Прибегая по необходимости к самым решительным мерам борьбы с контрреволюционным движением, помня, что борьба с контрреволюцией приняла формы открытой буржуазной борьбы, в которой пролетариат и беднейшее крестьянство не могут отказаться от мер террора, советская власть отвергает на основе, как недостойные, вредные и противоречащие интересам борьбы за коммунизм меры, отстаиваемые в указанной статье»[813]. Журнал «Еженедельник ЧК» за помещенную статью вскоре был закрыт. Всего в 1918 г. вышло 6 его номеров. Одновременно ВЦИК, продолжая работу по реорганизации ВЧК и разработке положения о чрезвычайных комиссиях, сформировал для этих целей специальную комиссию в составе Д. И. Курского, И. В. Сталина и Л. Б. Каменева.
Вскоре после выхода третьего номера «Еженедельника ЧК» с упомянутой выше статьей, против самоуправства чрезвычайных комиссий выступили представители ревтрибуналов, народных судов и местных исполкомов. Дискуссия постепенно переходит от критики методов террора к критике методов ВЧК. Большое количество критических материалов и статей было помещено на страницах центрального органа коммунистической партии газеты «Правды». Новый этап в дискуссии обозначила помещенная в ней статья М. С. Ольминского «О чрезвычайных комиссиях». В статье указывалось на ничем не ограниченную власть ЧК, констатировалась се внепартийность, самовластие и необходимость переподчинения местных и центральной ЧК[814].
В ответ на критическую статью в журнале «Еженедельник ЧК» была напечатана статья с таким же названием, но диаметрально противоположной оценкой выводов о характере деятельности чрезвычайных комиссий. В статье члена коллегии ВЧК В. В. Фомина говорилось: «Мы предлагаем вам, товарищ, привести хотя бы один пример о расстреле какого-либо коммуниста, если он не взяточник, не прохвост, и где случаи подбора специально «поводов для обвинения» этого привести вы не могли и не можете, так как таковых случаев нет. И где «не партийность» ЧК вы подметили? У нас имеются данные от большинства местных комитетов в нашей партии с пометой «на должности председателя ЧК старый партийный работник», «выдержанный коммунист» и т. п. Кроме того, право отвода, смещения и т. п. никто никогда у партийных коммунистов не отнимал и не намеревался отнимать»[815]. С поддержкой чрезвычайных комиссий выступили также в этом номере журнала такие известные политические деятели, как Г. Д. Закс, Г. Шкловский, а также исполком Ростовской области и Торошинский совет