1999(22 марта) — покушение на первого заместителя главы администрации Омской области Андрея Голушко (22.3.1999). Голушко тяжело ранен. ВВП — директор ФСБ РФ (25.07.1998 — 16.08.1999) и постоянный член Совета Безопасности РФ (с 01.10.1998, с 29.03.1999 — секретарь СовБеза РФ).
1999(28 марта) — попытка обстрела из гранатомета посольства США в Москве (28.3.1999). Один из террористов впоследствии дал интервью, в котором рассказал об участии в теракте, как был арестован и осужден. ВВП — директор ФСБ РФ (25.07.1998 — 16.08.1999) и постоянный член Совета Безопасности РФ (с 01.10.1998, с 29.03.1999 — секретарь СовБеза РФ).
1999(29марта) — ВВП назначен секретарем Совета безопасности РФ с сохранением должности директора ФСБ (25.07.1998 — 16.08.1999). За какие заслуги? Как за какие? А разве это не заслуги?
— Поджог здания УВД в Самаре (10.02.1999), погибло 57 сотрудников УВД.
— Взрыв на рынке во Владикавказе (19.03.1999), более 60 человек убито, более 100 ранено.
— Взрыв автомобиля у посольства США в Москве (17.01.1999) и имитация обстрела из гранатомета посольства США в Москве (28.03.1999).
— Более 30 громких убийств политических деятелей, известных всей России.
— Огромное число покушений на убийства.
— Многочисленные похищения людей в России, в том числе и иностранцев.
1999(31 марта) — убийство в Махачкале заместителя генерального прокурора Дагестана Курбана Булатова (31.3.1999). ВВП — директор ФСБ РФ (25.07.1998 — 16.08.1999) и Секретарь Совета Безопасности РФ (с 29.03.1999).
1999(март-август) — В это время скоропостижно умирают "от рака" оба родителя ВВП (отец Владимир Спиридонович Путин и мать Мария Ивановна Шеломова-Путина; похоронены в Ленинграде на Серафимовском кладбище. ВВП — директор ФСБ РФ (25.07.1998 — 16.08.1999) и Секретарь Совета Безопасности РФ (с 29.03.1999).
1999(4 апреля) — повторный взрыв под стеной здания приемной ФСБ на Лубянке (4.4.1999). По обвинению в организации этого взрыва были впоследствии осуждены три девушки из подпольной группы "Новая революционная альтернатива". ВВП — директор ФСБ РФ (25.07.1998 — 16.08.1999) и Секретарь Совета Безопасности РФ (с 29.03.1999).
1999(7 апреля) — директор ФСБ РФ (25.07.1998 — 16.08.1999) и Секретарь Совета Безопасности РФ (с 29.03.1999) ВВПутин сообщил в своем выступлении на телевидении, что предварительная оценка экспертов ФСБ и МВД признала подлинной видеозапись сексуальных развлечений генпрокурора Юрия Скуратова, и вновь высказался за добровольную отставку Скуратова. Он также заявил, что "мероприятие", зафиксированное на видеопленке, оплачивалось "лицами, проходящими по уголовным делам", расследуемым генпрокуратурой, и потребовал "объединить" материалы двух уголовных дел: дела по ст. 285 УК РФ ("злоупотребление служебным положением") против Скуратова и дела по ст. 137 ("вмешательство в частную жизнь") — против лиц, незаконно следивших за генпрокурором.