Поскольку Сталина при подготовке процесса над Бухариным меньше всего интересовала истина, опровержение Бухарина ничего не меняло, и на процессе «антисоветского право-троцкистского блока» 1938 года государственный обвинитель А. Я. Вышинский продолжал утверждать, что террористические директивы Семенов получал лично от Бухарина. Чуть позже Большая советская энциклопедия расставила соответствующие акценты:
Сейчас неопровержимо доказано, что в подготовке убийства великого Ленина участвовали и гнусные троцкистско-бухаринские изменники. Больше того, омерзительнейший негодяй Бухарин выступил в роли активного организатора злодейского покушения на Ленина, подготовлявшегося правыми эсерами и осуществленного 30 августа 1918 г.106
В 1938 году многих удивило, что это самое страшное обвинение Бухарин опровергать не стал.
НКВД к организации процесса подошел со всей серьезностью. 15 декабря 1937 года следователи допросили давно арестованного и отсидевшего почти всю свою сознательную жизнь бывшего эсера В. А. Новикова. По легенде Семенова, Новиков был одним из главных участников покушения на Ленина 30 августа 1918 года. Одетый матросом, он «появлялся» на сцене дважды: создавал затор толпы при выходе Ленина из цеха и бежал с револьвером к лежащему на земле раненому Ленину. После покушения он, дескать, умчался на ожидавшем его извозчике, а после ареста умудрился избежать расстрела, хотя и должен был разделить участь «Каплан» за соучастие в теракте.
В 1937 году Новикова допросили, и он сообщил о том, что Каплан жива:
Выписка из протокола допроса арестованного Новикова Василия Алексеевича, 1883 года рождения, от 15 декабря 1937 года.
Вопрос: Вы назвали всех бывших участников эсеровской террористической дружины, с которыми вы встречались в последующие годы?
Ответ: Я упустил из виду участницу покушения на В. И. Ленина — Ф. Каплан, которую встречал в Свердловской тюрьме в 1932 г.
Вопрос: Расскажите подробно, при каких обстоятельствах произошла эта встреча?
Ответ: В июле 1932 г. в пересыльной тюрьме в г. Свердловске, во время одной из прогулок на тюремном дворе, я встретил Каплан Фаню в сопровождении конвоира. Несмотря на то, что она сильно изменилась после нашей последней встречи в Москве в 1918 г., я все же сразу узнал ее. Во время этой встречи переговорить мне с нею не удалось. Узнала ли она меня, не знаю, при нашей встрече она никакого вида не показала. Все еще сомневаясь в том, что это Фаня Каплан, решил проверить это, и действительно нашел подтверждение того, что это была именно она... под другой фамилией — Ройд Фаня...