Повышенный интерес у ряда иностранных разведслужб, прежде всего английской, вызывали недавно вошедшие в состав Российской империи регионы Средней Азии. После образования в 1911 г. КРО штаба Туркестанского военного округа его сотрудниками был выявлен ряд завербованных англичанами агентов, а также профессиональных разведчиков.
На Дальнем Востоке контрразведчикам совместно с органами политической полиции пришлось вести борьбу с достаточно многочисленной агентурой японской разведки.
С первых дней своей деятельности контрразведывательные отделения обратили серьезное внимание на обеспечение сохранности секретов, сосредоточенных в штабах и других военных учреждениях. В этих целях в 1911–1912 гг. была приобретена агентура, начиная с уровня штаба бригады и выше. Как правило, в этих военных учреждениях имелось не более одного- двух агентов. Подбирались они в основном из числа писарей или мелких служащих. Следует отметить, что сфера деятельности военной контрразведки не ограничивалась только армией, но охватывала и наиболее важные гражданские оборонные объекты. К примеру, КРО штаба Московского военного округа имело агентуру на расположенном в Самарской губернии и выполнявшем военные заказы Трубочном заводе.
Агентура в штабах и других учреждениях была нацелена на выявление лиц, проявлявших необоснованный интерес к военным секретам. Привлекалась она и к расследованию фактов утечки секретной информации к противнику.
Незадолго до начала Первой мировой войны, 28 января 1914 г., министр внутренних дел, пользуясь полномочиями, предоставленными ему законом о шпионстве 1912 г., запретил в интересах защиты военных секретов сроком на один год опубликование в печати сведений, касавшихся вооруженных сил и в целом внешней безопасности России.
Важную роль в работе российской контрразведки в 1911–1917 гг. играли материалы перлюстрации корреспонденции и заявительские материалы. В отсутствие разветвленной агентурной сети они давали контрразведке возможность в какой-то мере отслеживать обстановку на всей территории империи.
Так, по материалам перлюстрации 19 декабря 1912 г. в Москве был задержан германский подданный Э. Гебауэр, зарегистрировавшийся в гостинице под фамилией Свидвинского. В результате обыска, проведенного силами сотрудников Московского охранного отделения в номере гостиницы, были обнаружены два паспорта на имя Свидвинского и Гебауэра, подозрительная переписка, телефоны воинских частей Варшавского гарнизона, жидкость для секретной переписки и ряд других материалов. Гебауэр был арестован и во время следствия не смог внятно объяснить причины своего нахождения в Москве и смены фамилии. Позднее он признался, что является офицером запаса германской армии и поддерживал отношения с некоторыми русскими воинскими чинами, у которых интересовался вопросами военной службы. Кроме того, Гебауэр предложил свои услуги для ведения разведки в интересах России на территории Германии.