Свой вклад в победу над врагом внес и Борис Евгеньевич Патон, который трудился рядом с отцом и, несмотря на огромную загруженность работой в цехах, много занимался наукой. За два года он провел ряд важных исследований статических свойств автоматов для сварки под флюсом. Он предложил наиболее простую и наглядную методику анализа работы автоматов по статическим вольтамперным характеристикам.
Как написано во вступительной статье «Життєвий i творчий шлях Бориса Євгеновича Патона» к «Бiблiографiï президента НАН Украïни академiка НАН Украïни Б. Є. Патона», в монографии «Экспериментальное исследование процесса автоматической сварки под слоем флюса», написанной в 1944 году совместно с А. М. Макарой, Борис Евгеньевич впервые проанализировал работу различных автоматов в статическом режиме. Затем он продолжил эти исследования, по результатам которых защитил в 1945 году кандидатскую диссертацию. В этом же, 1945 году Борис Евгеньевич возглавил электротехнический отдел института, в котором изучал электрофизические процессы дуговой сварки, создавал и исследовал новые источники питания. Его идеи значительно опережали время. Например, доступная и надежная силовая полупроводниковая техника, пригодная для реализации некоторых идей Бориса Евгеньевича, появилась сравнительно недавно.
В 1947 году вышла монография Бориса Евгеньевича Патона «Сварочные головки и питание их током». В последующих своих работах он показал, что оптимальными характеристиками обладает автомат с постоянной скоростью подачи проволоки, укомплектованный источниками питания с быстродействующим регулятором напряжения. Этот вывод, не утративший своего значения до сегодняшнего дня, стал принципиальной основой развития оборудования для механизированной сварки под флюсом и в защитных газах.
Своими трудами Борис Евгеньевич заложил основы теории автоматов для дуговой сварки. Он показал, что в условиях непроизвольных колебаний руки сварщика механизированная подача электрода возможна только при использовании электродной проволоки малого диаметра, когда явление саморегулирования выражено наиболее сильно. Этот вывод блестяще подтвердился экспериментально созданием полуавтоматов для сварки под флюсом, за разработку которых Борису Евгеньевичу Патону и его сотрудникам, а также работникам ленинградского завода «Электрик» в 1950 году была присуждена Сталинская премия СССР в области науки и техники.
Евгений Оскарович был рад успехам сына. Сам же он еще на Урале начал переориентировать работу коллектива на решение задач по восстановлению разрушенного войной народного хозяйства. В 1946–1953 годах Евгений Патон исследует проблемы сварного мостостроения, возглавляет работы по проектированию и изготовлению первых цельносварных мостов, в которых широко применялась автоматическая сварка. Он возглавил также исследовательские, проектные, заводские и монтажные работы, связанные с постройкой крупнейшего в мире цельносварного шоссейного моста через Днепр в Киеве.