Профессор физиологии И. М. Сеченов публикует итоговый труд «Элементы мысли».
Открытие Физического института Московского университета, который стал одним из центров разработки важнейших научных проблем.
Открытие при университете первой в России онкологической клиники, руководимой профессором Л. Л. Левшиным.
1904. Магистрант университета Н. А. Шилов разрабатывает учение о сопряженных реакциях окисления.
1905. 7–9 сентября. Студенческая сходка в университете с участием свыше 4 тысяч человек. Оценивая эту сходку и ее резолюцию, В. И. Ленин писал: «Резолюция эта по-настоящему, языком свободных граждан, а не пресмыкающихся чиновников, клеймит Государственную думу, как наглую издевку над народом, призывает к борьбе за республику, за созыв временным революционным правительством действительно всенародного и действенно учредительного собрания» (В. И. Ленин. ПСС, т. 11, стр. 346).
В университете впервые организована студенческая бригада. У входов в университет студенты возвели баррикады. Участие студентов в декабрьском вооруженном восстании.
Профессор университета физик Н. А. Умов разработал метод качественного! спектрального анализа цветных тел. Это исследование получило практическое применение в исследовании минералов.
Митинг рабочих и студентов во дворе университета. Осень 1905 года.
1906. Профессор университета Н. Е. Жуковский в труде «О присоединенных вихрях» разработал теорию подъемной силы крыла самолета, заложив основы аэродинамики.
Разрешено женщинам на правах сторонних слушателей посещать лекции в университете. Одной из первых на юридический факультет поступает И. Ф. Арманд.
1908. Под руководством профессора зоологии Г. А. Кожевникова организована близ Москвы Косинская лимнологическая станция университета. В Москве открыты. Высшие сельскохозяйственные курсы, созданные и руководимые профессором университета Д. Н. Прянишниковым.
1908–1910. Профессор В. И. Вернадский своими исследованиями вносит вклад в изучение процессов минералообразования и создает новую науку — геохимию.
1909. При Московском университете и Московском высшем техническом училище учреждается Общество содействия успехам опытных наук и их практических применений.
Оставленный при университетской кафедре геоботаники для подготовки к профессорскому званию В. В. Алехин своей первой работой «Очерк растительности и ее последовательной смены на Стрелецкой степи под Курском» заложил основу нового направления университетской геоботаники— изучение полей.
Создание профессором В. И. Вернадским радиевой комиссии с целью исследования месторождений радиоактивных минералов и изучения геохимии радиоактивных элементов.