В дальнейшем далеко не все орудия удалось восстановить. Кроме того, не было времени и было принято решение о строительстве дотов под неисправные орудия, в надежде на то, что их получится восстановить. 10 сентября 1941 года (спустя почти месяц после направления материалов на рассмотрение) штаб флота получил телеграмму № 3Н458, подписанную заместителем начальника Главного военно-морского штаба (ГМВШ) Алафузовым, о принципиальном одобрении плана сухопутной обороны Севастополя. ГВМШ сделал несколько замечаний к плану, в том числе указал на необходимость создания 3-й линии обороны в 3-м секторе и усиления 1-й линии 100- и 130-мм орудиями.
До 15 сентября 1941 года работы шли одновременно на двух рубежах: Противотанковом (он же Противодесантный, он же Тыловой) и Главном. Примерно в это же время было принято решение о строительстве 16 дотов на главном рубеже на наиболее танкоопасных направлениях. Так указано в докладе Я.М. Балицкого на военно-научной конференции
1961 года117. Изучение первичной документации показывает, что в данном случае речь идет о достройке дотов № 1—5 (намеченных и начатых постройкой еще в июне) и постройке 9 новых дотов (№ 38—46). Но основные силы были брошены именно на Передовой рубеж.
Генерал А.Ф. Хренов, находившийся в Севастополе, по дороге в Одессу внес предложение создать сплошной Передовой оборонительный рубеж, охватывающий все три сектора в 15—20 км от города. Решение правильное, обеспечивающее оборону города на расстоянии, не позволяющем обстрел города армейской артиллерией противника, но требующее большого количества ресурсов. Объективно говоря, этот человек с «великим стратегическим мышлением» допускал все время одну и ту же ошибку. Так же как и под Одессой, он не смог оценить реально свои силы (и так же, как и под Одессой, в результате оказалось, что толком не готов ни один рубеж).
К этому времени на двух рубежах (Главном и Тыловом) были построены 16 казематов, 3 командных пункта, 10 пулеметных дотов, 20 дзотов, заготовлено 27 комплектов сборных железобетонных огневых точек (СЖБОТ), изготовлено два комплекта СЖБОТ для 45-мм пушек 21К, заготовлено 20 комплектов материалов для дзотов на три пулемета «Максим»118 (обращаю внимание на то, что это не построенные доты, а именно заготовленные комплекты).
15 сентября 1941 года Военный совет флота назначил комиссию для выбора передового рубежа обороны Главной базы. В состав комиссии вошли П.А. Моргунов (председатель), В.Г. Парамонов, Е.И. Жидилов, Н.А. Егоров, М.Г. Фокин, Н.А. Баранов, Б.К. Соколов, П.И. Бухаров и командиры секторов.