15 мая 1946 года приказом министра Минсельхозмаша № 114сс в составе 6-го Главного управления был создан НИИ пороховых реактивных снарядов на базе ГЦКБ-1, получивший наименование НИИ № 1.
18 мая 1946 года приказом № 118сс НИИ-1 (бывший ГЦКБ-1) был включен в состав вновь образованного Главного управления по реактивной технике министерства.
В 1947 году приказом министра № 126 было утверждено Положение об институте НИИ-1 (организации с таким же названием существовали во многих отраслях, что считалось дополнительным условием соблюдения секретности работ).
Осенью 1946 года НИИ-1 Минсельхозмаша приступило к разработке 11 образцов ракетной техники:
– снаряда по типу германской пороховой ракеты «Рейнботе» для стрельбы на 50 км,
– реактивного авиаснаряда калибром 210 мм для стрельбы с самолёта по наземным целям,
– реактивного авиаснаряда калибром 82 мм для стрельбы по воздушным целям,
– противотанкового кумулятивного снаряда, способного пробивать 200 мм броню,
– реактивного зенитного снаряда по типу германской ракеты «Рейнтохтер» и других.
Впоследствии НИИ-1 относился к Государственному комитету по обороной промышленности и Министерству оборонной промышленности.
В марте 1966 года в связи с масштабной реорганизацией всей ракетной промышленности СССР НИИ-1 был переименован в Московский институт теплотехники Министерства оборонной промышленности СССР.
В 1968 году «за выдающиеся заслуги в создании, освоении и передаче народному хозяйству образцов новой техники» (за создание комплекса «Темп-С») институт был награждён орденом Ленина, а в 1976 году – вторым орденом Ленина (за создание комплекса «Темп-2С»).
В 1998 году преобразован в Федеральное государственное унитарное предприятие «Московский институт теплотехники».
По состоянию на 2009 год предприятие входило в структуру «Роскосмоса».
В конце 2010 года предприятие преобразовано в открытое акционерное общество "Корпорация «МИТ», в которое, помимо МИТа, вошёл ряд других предприятий. Общество вошло в структуру «Росимущества».
Директорами института в разное время были:
Саханицкий, Анатолий Викторович (1897-?) – директор с 1946 года по 1947 год
Дятлов, Дмитрий Григорьевич (1907-?) – директор с 1947 года по 1952 год
Бодров, Сергей Яковлевич (1905–1960) – директор с 1952 года по 1960 год
Надирадзе, Александр Давидович (1914–1987) – главный конструктор с 1958 года по 1961 год, директор и главный конструктор с 1961 года по 1987 год.
Лагутин, Борис Николаевич – директор и генеральный конструктор с 1987 года по 1997 год.
Соломонов, Юрий Семёнович – директор и генеральный конструктор – с 1997 года по 2009 год, генеральный конструктор с 2009 года.