В дальнейшем епископу Филарету пришлось послужить ещё в нескольких епархиях. В бытность свою архиепископом в Казани он много и успешно потрудился, чтобы прекратилось отпадение от Церкви людей, недавно принявших православную веру. Успеху дела очень способствовали пример его благочестивой жизни и чудесные явления, происходившие по его молитвам. Кроме того, архиепископ Филарет обратил в православие более 5000 язычников и многих раскольников, проживавших в его епархии.
Сердце казанского архипастыря всегда было преисполнено милосердием ко всем нуждающимся без различия национальностей. В голодные годы архиепископ Филарет, раздав всё своё состояние, брал взаймы, но не прекращал помогать голодающим. Оказывая помощь от себя, он располагал к этому и богатых жителей Казани. Во время эпидемии холеры архиепископ Филарет ежедневно сам совершал Божественную литургию в течение 40 дней.
В 1836 году архиепископ Филарет был назначен митрополитом Киевским и Галицким. 20 лет продолжалось его служение на Киевской кафедре. В это время с новой силой раскрылись замечательные черты владыки как доброго пастыря и мудрого наставника, заботливого воспитателя молодёжи, отзывчивого помощника бедным и сиротам и усердного молитвенника за всех. При точном и ревностном исполнении обязанностей, возлагаемых званием и долгом общественного служения, высокопреосвященный Филарет с особой строгостью исполнял все уставы и правила иноческого жития. Но, во всём строгий к себе, он в отношении к другим был весьма снисходителен и милостив и прибегал к мерам строгости только в исключительных случаях.
Стремясь к уединению, он летом большую часть времени проводил в Голосеевской пустыни, которая находилась недалеко от Киева. Здесь владыка на свои средства построил каменную церковь, а в остальном вёл себя, как самый простой инок.
С раннего детства митрополит Филарет сохранил великую нестяжательность, привык довольствоваться малым, и так продолжалось всю его жизнь. Он не делал сбережений, а всё, что имел, раздавал неимущим, сам иногда оставаясь без копейки. Так было во время посвящения его во епископа, когда он, получив назначение на епархию, не мог выехать из-за неимения средств и вынужден был занять деньги на дорогу у своего студента. Нищие были постоянными посетителями его дома, так что даже келейники смущались этим перед знатными лицами, посещавшими митрополита, а он совсем не смущался.
До самых последних дней своей жизни Киевский архипастырь был неутомим, как в трудах святительского служения, так и в подвигах иноческой жизни и — укрепляемый помощью свыше — переносил эти труды и подвиги с удивительной бодростью.