После падения Мальты от прежних владений Ордена остались Богемское и Бранденбургское приорства и объединение изгнанников в Ватикане. Было создано Российско-православное приорство и 98 командорств. Разрешено было учреждать фамильные командорства. Капитулу ордена был пожалован роскошный дворец на Садовой, ранее принадлежавший графу Воронцову*. На Каменном острове построили странноприимный дом в духе средневековых орденских традиций с католической церковью Иоанна Крестителя. Появилась собственная гвардия Великого Магистра из 198 рыцарей-кавалергардов. Павел I ездил в карете с мальтийским гербом, носил на груди мальтийский крест, кавалергарды - малиновые бархартные супервесты с белым крестом во всю грудь. 1799 год Павел I встречал в полном гроссмейстерском одеянии и в мальтийской короне. В июне 1799 г. в Павловске по древней орденской традиции в канун дня Иоанна Крестителя были зажжены костры" [16].
{* В настоящее время в этом дворце находится Суворовское училище, преобразованное из Пажеского корпуса.}
К избранию Павла I Великим Магистром Гавриил Романович Державин написал оду "На поднесение Его Императорскому Величеству Великого Магистерства Ордена св. Иоанна Иерусалимского и на победу над французами российским флотом, одержанную 1798 г." (см. Приложение № 15), за которую получил от Императора Мальтийский крест и табакерку с бриллиантами.
Обустройство Ордена в России
13 ноября 1798 г. Павел I подписал два указа, по которым на содержание командорств Мальтийскому ордену из казны ежегодно выделялось 216.000 рублей, и об образовании еще 10 новых командорств.
В этот же день Павел I утвердил именным указом роспись расходов на управление Ордена [68, № 18750]:
Главное управление.
Поручик Великого Магистра 7000 рублей.
Ему же на стол 12000 рублей.
Секретари:
Российских дел 800 рублей.
Немецких дел 800 рублей.
Итальянских дел 800 рублей.
На канцелярские расходы и почту 3000 рублей.
Департамент канцелярии 6600 рублей.
Департамент казенный 3600 рублей.
Департамент церемониальный 5000 рублей.
Духовенство орденское 6000 рублей.
На общие издержки 10400 рублей.
Итого: 56000 рублей.
Рядом с бывшим домом графа Воронцова, построенном Растрелли и подаренном Павлом I Ордену с названием "замок мальтийских рыцарей", архитектором Джакомо Кваренги была построена католическая церковь (капелла) во имя святого Иоанна Крестителя Иерусалимского, освященная 17 июня 1800 г. митрополитом римско-католической церкви в России Сестренцевичем. Для нее по проектам Кваренги были изготовлены трон Великого Магистра, светильники, разная утварь. Там же помещались казна, канцелярия Ордена и помещения для руководителей Ордена.