Шляхта Княжества, собравшись на полевой сейм под Витебском, уже в 1562 году приняла обращение к Сигизмунду Августу с просьбой об объединении с Польшей, для создания «общей обороны». В 1563 году варшавский сейм, при участии делегации Великого княжества, начал официально обсуждать условия такого объединения. Польская сторона, ссылаясь на старые акты времён Ягайлы, добивалась полной инкорпорации Княжества в состав Польши, но послы Литвы желали на равноправного союза. Сохранение независимости Великого княжества в предполагаемом союзе было принципиальной позицией литовских магнатов — Радзивиллов, Хадкевичей, Валовичей и других.
Споры продолжались не один год, между тем трудности войны всё острее требовали новых сил, — а конкретнее, военной помощи от Польши. Шляхта, наиболее страдавшая от неравной борьбы с Москвой, соглашалась на польские условия и просила монарха срочно созвать общий сейм для подписания унии.
Совместный сейм для рассмотрения вопроса об объединении собрался в январе 1569 года в Люблине. Вновь обнаружились принципиальные расхождения в предложенных делегациями условиях объединения. Польские сенаторы и послы Литвы даже свои совещания проводили отдельно. Поляки обратились к Сигизмунду Августу, чтобы тот заставил литвинов присоединиться к коронному сейму и принять польские условия. Возмущённая делегация Княжества оставила Люблин. Тем временем польские паны, используя момент, добились присоединения к Короне части земель Великого Княжества — Подляшья и Волыни. Затем точно так же были инкорпорированы Киевское и Брацлавское воеводства.
В Вильне возмущались, даже рассматривали возможность войны с Польшей, но ещё более ослабленному потерей богатых территорий Княжеству не оставалось ничего иного, как вновь прислать делегацию на Люблинский сейм. Магнаты-литвины делали всё, чтобы отстоять максимальную самостоятельность своего государства.
В конце концов, 1 июля 1569 года присягой присутствующих сенаторов и послов был принят акт государственной унии — явно компромиссный и поэтому противоречивый по содержанию. Польское Королевство и Великое княжество Литовское объединялись в «одну общую Речь Посполитую» с одним монархом (король польский являлся одновременно и Великим князем) и сеймом. Предусматривались также единая монета и единая внешняя политика; на всей территории объединённого государства провозглашались равные права шляхты.
Однако помимо унитарных принципов акт содержал и нормы федеративного объединения: Великое княжество сохраняло своё название и титул монарха, собственную армию, систему государственных должностей, казну и даже право. Правда, предусматривалась переработка Второго Статута, чтобы приблизить его к польскому своду законов, — но почему-то получилось так, что новый кодекс права, Статут 1588 года, наоборот, ещё больше отмежевал Литву от Польши.