Инициатива научного исследования Кашкулакской пещеры и вообще мест, где есть следы древних культовых площадок с аномальными свойствами, принадлежит директору новосибирского Института клинической и экспериментальной медицины (ИКЭМ) Сибирского отделения АМН СССР, академику АМН СССР В.П.Казначееву. В конце лета 1989 года состоялась шестая по счёту экспедиция учёных этого института в ту загадочную и зловещую пещеру с грудой полуистлевших человеческих и звериных костей.
А.Каманов, участник пятой экспедиции, приводит рассказ старшего научного сотрудника ИКЭМа А.В.Трофимова, не раз спускавшегося в эту пещеру: «И вдруг мне становится как-то не по себе, возникает неясное чувство тревоги. Дальше — больше, волнение нарастает. И вот я, который никогда не был трусом, трясусь весь, как осиновый лист, панический страх! А чего боюсь, сам не знаю. Потом ребят расспрашивал: я ними было то же самое».
О том же говорит и И.Барановский, участник шестой экспедиции: «Побывавшие в Кашкулакской пещере рассказывали удивительные вещи. В какой-то момент их вдруг охватывал беспричинный панический страх. Забывая обо всём, бросая снаряжение, они со всех ног мчались, обгоняя друг друга, на выход, к свету. Уже потом, придя в себя, никак не могли объяснить: что же случилось? И это были не новички — бывалые спелеологи, которые на своём веку повидали пещеры куда посложнее этой». Чем больше учёные интересовались пещерой, сообщает И.Барановский, тем чаще они встречали людей, испытавших на себе её магическое воздействие.
Наконец, это воздействие испытали и сами учёные. Вот как описывает то событие И.Барановский: «Было это в 1985 году. Сотрудник института Константин Бакулин с группой спелеологов обследовал гроты. После нескольких часов работы люди потянулись к выходу. Константин шёл последним. Закрепил верёвку на специальном поясе, обхватывающем грудь, и приготовился к подъёму. И вдруг почувствовал на себе пристальный взгляд. Учёного обдало жаром. Первое побуждение — бежать! Но ноги словно оцепенели. Посмотреть, что творится за спиной, было безумно страшно. И всё же, будто в состоянии гипноза повинуясь чьей-то чужой воле, повернул голову и увидел… пожилого шамана. Метрах в пяти. Развевающиеся одежды, мохнатая шапка с рогами, горящие глаза и плавные, зазывающие движения руками — мол, иди, иди за мной… Бакулин безотчётно сделал несколько шагов вглубь и тут — словно сбросив чары — начал отчаянно дёргать за верёвку…» Больше, сообщает И.Барановский, Бакулин в пещеру не спускался: «Но ещё долго шаман являлся ему во сне и звал за собой».