Открыв морской путь в Индию, португальцы лишили арабов монополии и подавили арабскую торговлю в Индийском океане. Но в начале следующего века португальцев вытеснили голландцы. Они заняли Банду, сразу поняв значение этих островов для своей торговли пряностями. Голландский губернатор Верхуфт превратил славящиеся мускатным орехом острова в опорный пункт нидерландской Ост-Индской торговой компании. Свободные островитяне стали подневольными рабочими, а точнее — рабами Ост-Индской компании.
Голландцы решили сосредоточить добычу мускатного ореха на острове Банда, гвоздики — на Амбоине и Тернате. Чтобы поддерживать высокие цены на эти продукты и держать их под своим контролем, они безжалостно уничтожали по всем Молуккским островам мускатные и гвоздичные деревья — основной источник существования островитян. Вспыхивавшие восстания, например на острове Амбоина в 1635 году, подавлялись голландской Ост-Индской компанией с неимоверной жестокостью. Острова Банда и Амбоина получили печальную известность виселицами, пытками, убийствами и вывозом рабов на продажу. Но этого было недостаточно торговцам Ост-Индской компании. Им мешали местные жители, они были не столь покладисты и покорны, как того хотелось завоевателям.
Воспользовавшись удобным поводом — нападением доведенных до крайности островитян на отряд адмирала Веревена, — «голландские культуртрегеры принялись за радикальные меры устранения препятствий к своим обширным коммерческим проектам», — пишет посетивший эти острова в 1902–1903 годах зоолог К. Н. Давыдов.[9] «Началась в буквальном смысле слова бойня, которой администраторы Ост-Индской компании не могли не быть довольны. Около 20 000 человек туземцев, т. е. почти все население острова, было уничтожено, оставшаяся горсть бежала с Банды на остров Кей, где и обосновалась».
«Голландцы сделались полными господами на островах Банда, основали здесь огромные плантации мускатных деревьев и объявили торговлю мускатным орехом монополией правительства (равно как Амбоина была сделана центром плантаций гвоздичных деревьев). Для работ на плантациях доставлялись с Явы и других мест тысячи малайцев-невольников. Ост-Индская компания богатела. Амбоина и Банда сделались важнейшими ее пунктами. В начале 70-х годов вошлого столетия монополия, наконец, была отменена, но пены на мускатный орех продолжали стоять огромные. На островах Банда усиленно работали предприниматели, сколачивались громадные состояния. Но эта счастливая пора лля плантаторов и торговцев пряностями миновала, когда плантации мускатника были разведены в других местах, например, англичанами на острове Пенанг, около Малакки, и цены на продукт сразу упали», — пишет К. Н. Давыдов.