По шагу кресел в экономическом классе (870 мм) самолет Ил-96 очень комфортабелен; особенно ощущается это в дальних многочасовых полетах.
После запуска ВСУ первую минуту в кабине иногда бывает небольшой запах дизельного выхлопа. Причиной этому является то, что створка ВСУ расположена низко и действительно может втягивать выхлопы от близко расположенной наземной техники.
На Ил-96 имеется бортовая вычислительная машина с печатающим устройством, обеспечивающая возможность фиксации всех основных полетных параметров во время любого этапа полета и распечатки для пользования экипажем на печатном бланке. Также самолет оборудован системой речевой предупредительной информации о возникновении нештатных режимов полета и, наряду с ней, визуальной сигнализацией, включающей в себя как предупредительные табло, так и индикацию на дисплее письменных рекомендаций по действиям экипажа в случае неисправностей и отказов.
Запуск двигателей, хотя и полностью автоматизированный (одно нажатие кнопки), требует повышенного внимания от бортинженера. В практике уже имелись случаи, когда в результате несвоевременных действий бортинженера двигатель повреждался при запуске. С момента начала запуска двигателей бортинженер ни на минуту не ослабляет внимания практически на всем протяжении полета. В дальний рейс стараются под разными предлогами (в качестве инструктора или проверяющего) записывать двух бортинженеров, хотя по штату положен один – как в свое время, когда на самолете стояла система И-42, записывали двух штурманов.
Хороший обзор из кабины обеспечивает удобное управление самолетом на рулении и разбеге. Имея сравнительно небольшой разброс внешних стоек шасси по ширине (10,4 м), самолет, несмотря на свои большие размеры, на земле достаточно маневрен. Однако большой размах крыла требует от пилотов повышенного внимания к наличию препятствий в зоне руления.
В этой связи нельзя не привести драматичный случай с самолетом №96009, произошедший в аэропорту Южно-Сахалинск 2 июня 2001 года и попавший даже на телеэкраны. После посадки при заруливании на стоянку самолет Ил-96 правой плоскостью (законцовкой) повредил стоявший не по разметке самолет Ил-62 авиакомпании "CAT". Обе авиакомпании из-за задержек своих рейсов и повреждения самолетов понесли значительные убытки. Ил-96 с демонтированными вертикальными законцовками крыла специально вызванный экипаж летчиков-испытателей перегнал без пассажиров в Воронеж, где ремонт самолета, по сведениям авиакомпании "ДАЛ", обошелся в совершенно неадекватную многомиллионную сумму (к вопросу о финансовой политике базовых структур отечественного авиапрома по отношению к эксплуатантам). Руководством аэропорта Южно-Сахалинск была сделана попытка обвинить экипаж авиакомпании "ДАЛ" – хотя совершенно очевидно, что этот случай был спровоцирован в первую очередь тем, что Ил- 62 находился вне зоны стоянки, за что несут ответственность наземные службы. Тем не менее большой размах крыльев Ил-96 требует от экипажей осмотрительности при рулении, особенно если учесть, что с рабочего места летчика, выполняющего руление, законцовка крыла практически не видна (но вообще летчик на рулении должен смотреть не назад, а вперед, и не следует навешивать на него ответственность за то, что не входит в пределы его компетенции – в частности, заставлять решать проблемы наземных служб).