Портрет Лукреции работы Леонардо, известный как «Прекрасная Ферроньер» (по названию декоративной ленты на лбу) и картина «Мадонна в гроте», на которой Лукреция предположительно запечатлена в образе Марии, хранятся в Лувре.
Несчастья не оставляли Изабеллу Арагонскую, которая даже письма свои подписывала как «женщина, привыкшая к унижениям». Она тоже провела много лет в Мантуе под покровительством Изабеллы. Позднее Изабелла вернулась в Неаполь, где и умерла в 1524 году. Прекрасный рисунок Джованни Больтраффио, изображающий Изабеллу Арагонскую, стал эмблемой галереи Амброзиана в Милане. Оригинал слишком хрупок для того, чтобы его можно было выставлять.
Европейская слава Леонардо да Винчи не спасла художника от денежных проблем, которые продолжали его преследовать. После недолгой остановки во Флоренции Леонардо отправился в Рим, где работал для Джулиано де Медичи, но к тому времени здоровье художника начало ухудшаться. В 1516 году французский король Франциск I предложил великому мастеру поселиться в поместье Клуа, неподалеку от его замка в Амбуазе. Здесь Леонардо и провел последние дни, систематизируя свои записки. Умер он второго мая 1519 года вскоре после своего шестидесятисемилетия. Миланский период его творчества считается самым продуктивным.
Портрет Беатриче д'Эсте кисти Леонардо на южной стене трапезной Санта Мария делле Грацие от времени почти стерся, но ее бледный профиль все еще можно разглядеть на фреске Монторфано. Напротив — «Тайная вечеря» Леонардо. Прекрасный бюст Беатриче работы Кристофоро Романо хранится в Лувре, а великолепная гробница Лодовико и Беатриче ныне находится в Павии.