Вскоре он убедился, что испанцы успели увезти запасы золота и дорогую церковную утварь. Много ценностей, правда, было спрятано в тайниках покинутых домов и монастырей, но никто не мог указать, где находятся эти тайники. Тогда Морган решил, что тяжелый металл легче всего искать среди легкого пепла и приказал сжечь Панаму.
Цветущий город превратился в пепелище, на котором флибустьеры действительно обнаружили немало золота.
Можно было возвращаться с добычей назад. С удивительной легкостью пираты забыли перенесенные тяготы и страдания, каждый, кто оставался в живых, чувствовал себя богачом. Обратный путь показался легким. Уже в гавани, на берегу Карибского моря, перед посадкой на корабли, кто-то предложил, по старому пиратскому обычаю, обыскать друг друга. Не утаил ли кто часть добычи? Все ли честны перед товарищами?
Все было сдано в общий котел. Приступили к дележу. И тут выяснилось, что каждому полагается ничтожная сумма - десять фунтов стерлингов.
Пираты отлично знали, что добыча, которую с трудом несли на себе двести муллов, должна была быть во много раз ценнее, нежели это пытался доказать Морган. Начали вспоминать, что при разделе не оказалось многих предметов, которые своими руками участники похода добыли среди дымящихся развалин Панамы. Назревал бунт.
За поздним временем спор решили отложить до утра.
Утром корабля Моргана в бухте не оказалось, под покровом ночи он снялся с якоря и ушел, уведя или потопив остальные суда.
Ни кораблей, ни провизии, ни боеприпасов Морган своим обманутым соратникам не оставил. О погоне не могло быть и речи. Пришлось строить каноэ, а припасы отнять у местных жителей. Большинству пиратов предательство Моргана стоило жизни: пересечь море на утлых суденышках им не удалось.
А Морган 31 мая 1671 года вернулся на Ямайку. И хотя через год его под стражей, как преступника и нарушителя договора между Англией и Испанией, повезли в Англию, наказания пиратский адмирал избежал. Более того, он был возведен в рыцарское достоинство и назначен вице-губернатором Ямайки.
Бывший пират приобрел огромные плантации и сотни черных рабов. Конец жизни он спокойно провел в вице-губернаторском даме в Порт-Рояле. Иногда ему приходилось ездить в Англию, для того, чтобы осудить и повесить кого-либо из старых соратников.
Морган был похоронен со всеми почестями на кладбище Порт-Рояля. По его завещанию все награбленные богатства перешли жене и сыну.
Впоследствии капиталы семьи Морганов пере кочевали с Ямайки в США
Его потомки овладели более совершенными оружиями грабежа, нежели дедовский пистолет и абордажная сабля, но по семейной традиции Морганы и сейчас живут на воде в роскошной яхте "Корсар".