Мошкович, вошедший во вкус сельскохозяйственного бизнеса, решил расширить производство: его компания начала заниматься выращиванием зерна и переработкой масличных культур. В 2000 г. появилась компания «Русагро-Инвест», которая объединила все агропроекты Мошковича. В 2001 г. «Русагро» уже стала крупным холдингом, в составе которого – Краснодарский МЖК, два элеватора и Усть-Лабинский сахарный завод в Краснодарском крае. В том же году «Русагро» слилась с предприятием «Роспрод», владеющим сахарным заводом в Тамбовской области и 57 % акций Аннинского МЭЗа в Воронежской области. Мошкович, в сущности, выкупил «Роспрод» у Сбербанка за $ 20 млн.
Позже в СМИ писали, что вся сделка затевалась не ради полученных предприятий, а ради кредитной линии, которой пользовался «Роспрод» в Сбербанке, – в общей сложности $ 120 млн. Частично эти деньги пошли на покупку у государства квот на импорт сахарного сырца. В 2001 г. в собственности «Русагро» уже 50 000 га земли, в совокупности все заводы Мошковича производят в год около 900 000 тонн белого сахара.
В 2003 г. сахарная империя Мошковича под угрозой. С одной стороны, государство, наконец, пришло в себя и стало наводить порядок на рынке – поставки сахара в страну стали контролировать госорганы. С другой – сами участники рынка взялись за налаживание цивилизованной системы взаимодействия. Мошкович оказался в центре конфликта с компанией «Русский сахар», часть акций которой «Русагро» приобрела в 2001 г.
Председатель совета директоров «Русского сахара» Михаил Липский так описывал в прессе случившееся: «Суть конфликта состоит в том, что взгляды акционеров „Русского сахара“ и г-на Мошковича на сахарный рынок принципиально отличаются. Акционеры не согласны с политикой сокрытия прибыли сахарными заводами. Имея акционером г-на Мошковича, мы не могли активно проводить нашу политику в сахарной отрасли. Сегодня мы готовы более активно защищать установление справедливых отношений на рынке».
Компания «Русагро» собрала внеочередное собрание акционеров, пытаясь отстранить руководителей «Русского сахара» от управления. Однако осуществить этот план не получилось. В результате Мошковичу пришлось все-таки отказаться от «Русского сахара». Правда, не без выгоды для себя: он получил долю акций в одном из заводов «Русского сахара», причем выкупил их в два раза дешевле рыночной стоимости.
Сразу после этого Мошкович взялся за поставки в Россию сахарного сиропа. Причем опять в обход налогов, в чем признался сам: «Мы целый год „закрывали“ сироп для ухода от высоких пошлин. В 2002–2003 гг. сахар-сырец растворяли в воде и ввозили в Россию под видом сиропа».