Перед войной американская и японская доктрины использования подводных лодок были схожи. Лодки должны были уничтожать в основном вражеские военные корабли. На практике, если не считать нескольких специальных операций в поддержку действий флота, американцы использовали свои лодки так же, как немцы — для уничтожения вражеского торгового флота. Зато японские лодки, которые были такими же большими, имели надежные торпеды, а в начале войны были и столь же многочисленными, как наши. Однако они сосредоточились исключительно на уничтожении военных кораблей. Как мы видели, в 1942 они добились неплохих успехов. Но по мере усиления американской ПЛО японские лодки все реже добивались результата. Например, в ходе операции на Лейте японцы развернули в районе боев 16 лодок. Они сумели потопить лишь 1 эскортный миноносец. И вообще, большая часть японского подводного флота была распылена для выполнения различных специальных заданий. Они проделывали огромные переходы для проведения ночных обстрелов берега на островах Мидуэй, Джонсон и Кантон в 1942, позднее Ванкувера и Орегона. Японские лодки с гидросамолетами на борту проводили бессмысленные разведывательные полеты. Но смертельный удар японским подводным силам нанесла собственная армия, когда обнаружила, что лодки могут успешно доставлять снабжение на изолированные острова. Поэтому все больше и больше лодок отзывались с патрулирования, чтобы доставлять осажденным гарнизонам рис и патроны. К 1943 Соединенные Штаты прекратили конвоирование торговых судов на Тихом океане и переключили эскортные корабли на решение иных задач. По данным Ито Масанори Япония имела в начале войны 64 подводные лодки. За время войны было построено 126 единиц, и к моменту начала боев за Лейте в строю осталось всего 32 лодки. В эти цифры не включены сверхмалые лодки.
Достаточно странно, буквально на грани полного идиотизма, выглядит неспособность островного государства защитить свои морские коммуникации.
Это можно объяснить лишь одним. Японская военщина отказывалась признавать факты, если они могли привести к ведению оборонительной войны. По той же причине в японский флот в 1942 — 43 решил построить 20 авианосцев, которые не могли использоваться в рамках оборонительной стратегии. «Синано», третий линкор типа «Ямато», тоже был переоборудован в авианосец. Однако из этих материалов можно было построить несколько сотне эсминцев и эскортных кораблей. Только в конце 1943 был создан эскортный флот, который так и не стал значительной силой. Японцы завершили войну с тем же противолодочным оружием, что и начали — крайне неточные корабельные и авиационные глубинные бомбы. Они никогда не проводили математический анализ, как лучше сбрасывать хотя бы ЭТИ бомбы, чтобы с наибольше вероятностью накрыть лодку. Японцы не имели отработанных методов противолодочных действий и наивно верили, что уничтожают американскую лодку при каждой атаке. Они сумели потопить достаточно много наших лодок, но этого было совершенно недостаточно для победы.