После этих действий, Галдан становится властителем солидного джунгарского государства, протянувшегося от Или до юга Кобдо, где Дорботы, остатки Хошотов и Хоиты, короче, все, не эмигрировавшие джунгарские племена, беспрекословно повиновались правящему дому Чоросов. Таким же образом, Чингиз-хан ещё сравнительно недавно объединил под эгидой рода Бортчигин всех Монголов XIII в. Располагая верными соратниками, объединившимися вокруг Тарбагатайской вотчины, Галдан предпринял действия по завоеванию Центральной Азии.
Прежде всего, он вступил в Кашгарию. Было очевидно, что религиозные семейства ходжей постепенно ослабляли в этой стране власть ханов из дома Чагатая, и тайно заменяли или дополняли старое ханство Чингизханидов своего рода мусульманским клерикализмом, исламским теократизмом. Два семейства ходжей, так называемые Ак-таглыки и, так называемые, Кара-таглыки захватили реальную власть, первые в Кашгаре, вторые в Яркенде. В 1677 г., последний хан, – Исмаил, попытался вытеснить и изгнать из Кашгара лидера Актаглы-ков, Ходжу Хазрата Апака. [1408]
Хазрат Апак бежал в Тибет, где он просил о посредничестве Далай-ламу. Демарш может показаться странным, если подумать о той пропасти, которая разъединяет буддистскую религию от магометанской религии. Однако на месте выяснилось, что, несмотря на политические интересы, и, несмотря на полное противостояние доктрин, неба и земли, два клерикализма понимают друг друга. "Папа Буддизма", который всегда воспринимал Галдана как своего давнего "мальчика из хора", который прислушается к его словам, предложил ему восстановить в Кашгаре представительство Магомета. Галдан подчинился с такой готовностью, словно эта миссия послужила бы ему своего рода адвокатом между Ламаизмом и Мусульманством, не принимая уже в расчет то, что это позволяло ему установить джунгарский протекторат над Кашгарией.
Это произошло. Галдану не составляло большого труда оккупировать Кашгарию. Он схватил хана Исмаила и отправил его в неволю, в Кульджу на реке Или (1678-1680). Не довольствуясь тем, что ходжа Хазрат Апак восстановился в должности вице-правителя Кашгара, он ему дал ещё и Яркенд в ущерб другой соперничавшей группировке ходжей, а именно Каратаглыков, у которых Яркенд всегда был основной резиденцией. Таким образом, Кашгария в целом стала простым протекторатом Джунгар, где Ходжи были всего лишь местными представителями чороских ханов. Это хорошо видно, когда после смерти Хазрат Апака, старые стычки между двумя семействами ходжей – Ак-таглыками и Каратаглыками, возобновились. Джунгары стремились удовлетворить всех, арестовав лидеров обеих кланов, актаглыка Ахмеда-ходжу, и каратаглыка Даниала-ходжу. Затем они решили вопрос в пользу Даниала-ходжи, и назначили его вице-правителем Кашгарии (1720) с центром в Яркенде, но требовали от него признать унизительный вассалитет джунгарскому хонтайджи в Кульдже. Более того, джунгарские вельможи обладали обширными поместьями в Кашгарии.