Кроме того, ученый рекомендовал проводить еще и специальные мероприятия по очищению полей от сорной растительности: прополку, мотыжение, пахоту, боронование, обработку междурядий пропашных культур.
Болотов впервые в истории земледелия подошел к решению проблемы борьбы с сорняками с научных позиций.
Много сил и времени отдал Андрей Тимофеевич изучению сорняков. Благодаря ему наука получила описание их биологических особенностей. Прежде всего ученый обращал внимание на громадное многообразие видов подобных растений. Он указывал также на исключительную способность сорняков к выживанию в неблагоприятных условиях и усиленному размножению.
Болотов выделил наиболее существенные признаки сорняков (продолжительность вегетации, ярусность расположения, способы размножения) и положил их в основу своей классификации.
По продолжительности вегетации Андрей Тимофеевич группировал сорняки на: яровые однолетники, живущие только один сезон; озимые или годовые, требующие для полного развития не менее года; временные сорные растения, растущие несколько лет; долговременные сорняки - многолетние растения. Сорняки, относящиеся к последней группе, Болотов считал самыми вредными, а борьбу с ними наиболее трудной. К таким сорнякам он относил все виды пырея, дикую рябину, полынь.
Болотов классифицировал сорняки и по морфологическим признакам - строению корневой системы, ярусности; растений, строению семян.
По строению корневой системы ученый делил сорняки на «малокоренные» со стержневыми корнями, уходящими глубоко в землю, и «коренистые», имеющие мочковатые корни, располагающиеся в верхних слоях почвы. По мнению Болотова, последние приносят огромный вред, так сильно угнетают корневую систему хлебных растений.
По ярусности ученый классифицировал сорняки на имеющие низкий, средний или высокий стебель. Кроме того, Болотов учитывал облиственность растения, его кустистость, устойчивость стебля (прямостоячий, вьющийся стелющийся).
Классифицируя сорняки по строению семян, Андрей Тимофеевич обращал внимание на величину и форму семян, внешний вид их оболочки (гладкая, шероховатая строение околоплодника, способ высвобождения из плода, состав запасных питательных веществ (мучнистые, маслянистые, сахаристые).
Болотов описал также три способа размножения сорняков: только своими корнями, укоренением наземных стеблей, семенами. Кроме того, он отмечал, что некоторые сорняки могут размножаться сразу несколькими способами.
Сорняки, размножающиеся корнями, ученый разделял на те, что «размножаются более разделением и разрыванием своих кореньев, и производят от них от часу более побочных отраслей вверх» (корнеотпрысковые), и те, «которые, напротив того, сами отсылают от себя под землею колонии, производя плети, которые расстилаясь под землею, множество побочных новых кустов производят» (корневищные).