30 апреля 1980 г. полку было вручено Боевое знамя, и с того времени этот день ежегодно празднуется как День части.
Однако боевая работа продолжалась, и полк продолжал нести потери. Так, за первый (1980) год войны полк потерял восемь вертолетов (три сбиты огнем противника и пять разрушены при аварийных посадках). Всего же летчики полка выполнили 12 278 боевых вылета с налетом в 15 591 час. В результате боевых действий было уничтожено 32 огневые точки, 38 опорных пунктов мятежников, 21 склад, 4 ДШК, 41 штаб и крепость, а также более 1200 инсургентов.
В 1981 г. за плечами летчиков 50-го осап уже 18 684 боевых вылета и 33 поврежденных вертолета.
Очень тяжелым выдался третий год войны – 1982-й: 15 272 боевых вылета, потеряно 19 вертолетов и 14 человек личного состава.
Каждая потеря была очень тяжелой, однако самый большой удар был нанесен 8 мая, когда в сбитом вертолете погиб весь руководящий состав 3-й эскадрильи: командир эскадрильи майор Грудинкин, замполит капитан Садохин и штурман эскадрильи капитан Кузьминов.
А 7 октября 1982 г. после выхода из атаки в районе горы Катасанг был обстрелян из ЗГУ и взорвался в воздухе Ми-24Д капитана С. Спелова. Экипаж погиб, спасая высаженную группу десантников.
К 1983 г. в полку служили 355 человек: 175 офицеров, 81 прапорщик, 33 сержанта, 36 солдат. В том числе: 54 летчика, 27 штурманов, 45 летчиков-операторов, 51 борттехник и 77 человек инженерно-технического состава.
Не стало легче и в последующие два года (1984–1985). Именно в этот период советское командование намеревалось переломить ситуацию, пытаясь уничтожить организованное сопротивление моджахедов. И без летчиков пятидесятки не обходилась ни одна более или менее крупная операция. Тут и огневая поддержка и разведка (на Ан-ЗОБ и Ан-26РР), обеспечение связи (Ан-26РТ), корректировка огня и многое-многое другое.
В 1985 г. моджахеды получили достаточное количество средств для борьбы с авиацией, в том числе и ПЗРК. Это не могло не сказаться в том числе и на потерях полка. Впервые за войну в этот год к восьми сбитым вертолетам добавились и два сбитых самолета.
Так, 11 марта 1985 г. в районе Панджшерского ущелья «Стингером» был сбит самолет-разведчик Ан-ЗОБ (при попытке посадки на аэродром Баграм погибли капитан А. Горбачевский и старший лейтенант В. Иванов).
Летом того же года душманам удалось сбить два Ми-24 и два Ми-8, а также повредить двенадцать Ми-24 и десять Ми-8. Характерны, например, события 14 сентября, когда в ходе прикрытия вывоза раненых афганских солдат тяжелые повреждения получила двадцатьчетверка капитана Сергея Филипченкова. Несмотря на то что вертолет был буквально изрешечен (механики потом насчитали 132 (!) пробоины) и убит оператор старший лейтенант Миронов, летчик смог посадить практически неуправляемую машину на брюхо. Позже командир вертолета 2-й эскадрильи капитан Филипченков участвовал в 22 операциях и стал Героем Советского Союза. Не менее героическими были и будни 3-й эскадрильи: так, капитан Владимир Кучеренко на своем Ми-8МТ совершил 1400 (!) боевых вылетов и тоже стал Героем Советского Союза.