Когда Кудрина назначили министром, Маргания и Виноградов включились в войну за контроль над российским алмазным монополистом АК «АЛРОСА». В 2001 году, во время выборов президента Якутии, Винокуров обратился в прокуратуру с требованием привлечь главу региона Михаила Николаева к уголовной ответственности по ряду статей УК РФ (речь шла о просрочке платежей местным Минфином). Журнал «Компания» писал, что действия «БАЛТОНЭКСИМ Финанс» могли осуществляться по желанию Маргания, бывшего тогда внештатным советником Кудрина. В конце концов Николаев снял свою кандидатуру, выборы выиграл Вячеслав Штыров, после чего наблюдательный совет алмазной компании возглавил министр финансов. «АЛРОСА» начала размещать крупные суммы на депозитах в банке Маргания и Винокурова.
Журнал Forbes так описывал систему принятия ключевых решений в алмазной отрасли России: «Имя… Отара Маргания в индустрии драгоценных камней хорошо известно. Он работает внештатным советником вице-премьера и министра финансов Алексея Кудрина. Кудрин возглавляет наблюдательный совет «АЛРОСА» и курирует отрасль. А Маргания, по мнению опрошенных Forbes экспертов, имеет большое влияние на министра. Собеседники Forbes уверены также, что именно его компаниям принадлежит сейчас значительная доля неподконтрольных «АЛРОСА» акций инвестиционной группы».
Под «инвестиционной группой» подразумевается ОАО «ИГ «АЛРОСА». Основным собственником этого акционерного общества, согласно СПАРК-Интерфакс, оказался не связанный с АК «АЛРОСА» частный капитал. Этой группе якобы переданы крупнейшие месторождения золота и драгоценных камней страны: до 200 млн каратов алмазов в Архангельской области и 700 тонн золота в Якутии.
ИГ «АЛРОСА» сформировалась из структур московского «Собинбанка», фигурировавшего в скандале об отмывании миллиардов долларов через американский Bank of New York (BoNY). Как сообщает Forbes, «на слушаниях в суде Южного округа Нью-Йорка по делу о $15,3 млн, арестованных на корсчете «Собинбанка» в BoNY… суд согласился с мнением американских властей о том, что корсчет Собинбанка, как и ряд других счетов, послужил «каналом для тайных переводов из России примерно $7 млрд с целью финансирования подозрительных или нелегальных операций».
С 2001 года председателем правления ИГ «АЛРОСА» числился, по данным журналистов, совладелец Собинбанка Халид Априлевич Омаров, известный еще как Халид Апрель-оглы Омаров и Халид Опрел-оглы Омаров. До 1997 года банкир жил в Санкт-Петербурге, где, как указывали газеты, познакомился с Отаром Маргания. Омаров считался бизнесменом, близким к чеченской общине.