Ф. 154. Жалованные грамоты на вотчины, чины и дворянство
Ф. 197. А. Ф. Малиновский
Ф. 235. Патриарший Казенный приказ
Ф. 237. Монастырский приказ
Ф. 248. Сенат и его учреждения
Ф. 281. Грамоты Коллегии экономии (ГКЭ)
Ф. 375. Исторические сочинения
Ф. 389. Литовская метрика
Ф. 1193. Троицкий Макарьев Калязин монастырь
Ф. 1202. Солотчинский монастырь
Ф. 1441. Кирилло-Белозерский монастырь
Ф. 1606. Кирилло-Новоезерский монастырь
Российский государственный исторический архив
Ф. 834. Синод. (Оп. 3: Рукописи Синода)
Ф. 1343. Департамент герольдии
Geheimes Staatsarchiv Preussischer Kulturbesitz (Берлин-Далем)
Herzogliches Briefarchiv, В (Polen), D (Livland)
2. Опубликованные материалы
2.1. Каталоги и описания грамот XVI в.
Антонов А. В. Вотчинные архивы московских монастырей и соборов XIV–XVII веков // РД. М., 1997. Вып. 2. С. 73–225[2726].
Антонов А. В. Частные архивы русских феодалов XV — начала XVII века. М., 2002 (РД. Вып. 8).
Енин Г. П. Описание документов XIV–XVII вв. в копийных книгах Кирилло-Белозерского монастыря, хранящихся в Отделе рукописей Российской национальной библиотеки. СПб., 1994.
Зимин А. А. Хронологический перечень актов архива Суздальского Спасо-Ефимьева монастыря (1506–1612 гг.) // АЕ за 1962 г. М., 1963. С. 366–396.
Каштанов С. М. Хронологический перечень иммунитетных грамот XVI в. [Ч. I] // АЕ за 1957 год. М., 1958. С. 302–376.
Каштанов С. М. Хронологический перечень иммунитетных грамот XVI в. Ч. II // АЕ за 1960 г. М., 1962. С. 129–200.
Каштанов С. М., Назаров В. Д., Флоря Б. Н. Хронологический перечень иммунитетных грамот XVI в. Ч. III // АЕ за 1966 год. М., 1968. С. 197–253.
Описи Царского архива XVI в. и Архива Посольского приказа 1614 г. / Под ред. С. О. Шмидта. М., 1960.
Перечень актов Архива Троице-Сергиева монастыря. 1505–1537 / Отв. ред. С. М. Каштанов. М., 2007.
Шумаков С. А. Обзор «Грамот Коллегии экономии». М., 1899–1917. Вып. I–IV; М., 2002. Вып. 5.
2.2. Сборники документов
Акты исторические, собранные и изданные Археографическою комиссиею. СПб., 1841. Т. I.
Акты, относящиеся до гражданской расправы древней России. Собрал и издал А. Федотов-Чеховский. Киев, 1860. Т. I.
Акты, относящиеся к истории Западной России, собранные и изданные Археографическою комиссиею. СПб., 1848. Т. II.
Акты Российского государства. Архивы московских монастырей и соборов XV — начала XVII в. / Отв. ред. В. Д. Назаров. М., 1998.
Акты Русского государства 1505–1526 гг. М., 1975.
Акты служилых землевладельцев XV — начала XVII в. / Сост. А. В. Антонов. М., 1997–2008. Т. I–IV.
Акты, собранные в библиотеках и архивах Российской империи Археографическою экспедициею имп. Академии наук. СПб., 1836. Т. I.