Важную роль в развитии тибетской буддийской йоги в период с VIII по XV вв. сыграли индийские учителя тантрического буддизма Падма Самбхава, Атиша, Тилопа и Наропа; а также ученик Наропы, тибетский духовный подвижник, поэт и переводчик Миларепа; ученик Миларепы, основатель манашеского ордена Карджиут-па Гампо-па; ученик Атиши, основатель манашеского ордена Кадам-па Домтон; философ и реформатор Цзонг к’апа (Цзонхава).
В этот же период методы йоги в своей религиозной практике начинают использовать некоторые последователи ислама и христианства. Среди различных течений ислама, вероятно, самое сильное влияние йоги на себе испытал суфизм. Это неортодоксальное мистическое направление зарождается в недрах раннего ислама в VII–VIII веках как реакция на официальный ислам, лидеры которого политическим завоеваниям и материальному благополучию начинают уделять больше внимания, чем духовному совершенствованию. Подобно индийским йогам суфии не отвергали религиозный культ, но полагали, что ритуальные богослужения и обряды имеют весьма незначительную ценность по сравнению с личным внутренним опытом духовного преображения. Они уважали традицию духовного наставничества, использовали медитации с постоянным повторением имени Бога и других сакральных формул, аскетическую практику, специальные танцы и стремились к достижению внутреннего озарения и слияния с Богом. К числу известных средневековых последователей суфизма принадлежали Аль-Басри, Абу аль-Мухасиби, Абу Язид, Джунайд, Халладж. Чуть позже, в XII–XIII веках идеи суфизма поддержали такие крупные арабские мыслители как Газали, Сухраварди, Ибн аль-Араби.
Если суфизм можно считать определенной разновидностью йоги в лоне культурно-религиозной традиции ислама, то исихазм — почти то же самое в религиозной традиции восточного христианства. Понятие «исихазм» происходит от греческого «исихия», что означает безмолвие, «покой» или «отрешенность». Характерные элементы исихазма — строгий аскетизм и практика «умной молитвы» (в уме) — то есть многократное мысленное повторение определенной сакральной фразы. Историки полагают, что подобная практика в христианстве сложилась под влиянием древних египетских и синайских аскетов, которые жили в пустынях уединенно подобно индийским отшельникам и, вероятно, были знакомы с элементами йоги.
Исихазм был широко распространен в период позднего Средневековья (XI–XVI вв.) в Византии и на Руси. Известные русские религиозные мыслители и духовные подвижники Сергий Радонежский, Феодосий Печерский, Нестор Летописец, Нил Сорский, Вассиан Патрикеев, Максим Грек выросли на идеях восточного мистического христианства, пропитанного исихазмом. Позже элементы исихазма проникли во многие православные монашеские общины и использовались для достижения духовного очищения от всего мирского и приобщения к Богу.