Кроме хвостовой пулеметной установки у «Е» для защиты самолета от атак снизу и сзади – излюбленного направления истребителей – имелось так называемое «воронье гнездо» – специальная площадка около двух метров длиной, которая на шарнире могла отклоняться одним концом вниз. Одновременно на особом кронштейне опускался и пулемет. Еще четыре огневые точки предусматривались по бортам «Ильи Муромца»-Е. Новая «летающая сверхкрепость» имела полный сферический обстрел.
Присланные летом на базу Эскадры в Псков «Муромцы»-Е были собраны, и в конце июля 1916 г. И.И. Сикорский уже участвовали в сдаче первой «летающей сверхкрепости» (№ 265) с двигателями «Рено» 225 л.с. Во время полета 27 июля возникла аварийная ситуация. Вдруг одновременно остановились все четыре двигателя (как потом выяснилось, в дренажную систему бензобаков не стал поступать воздух). За штурвалом находился капитан Нижевский. Сикорский не стал сменять опытного пилота. Нижевский спланировал, заложил крутую спираль, и посадил «Муромца» в центре аэродрома. Этот полет подчеркнул прекрасные планерные и пилотажные качества «Муромца», его послушность воле пилота даже в такой экстремальной ситуации, легкость управления, соизмеримую с малыми аппаратами. Нижевский и Алехнович стали командирами первых «Е», поступивших в Эскадру.
Испытания корабль прошел успешно, приемная комиссия пришла к выводу, что новый тип «Муромца» имеет по всем показателям заметные преимущества по сравнению со всеми аппаратами всех типов «Г». Экипажи новых «Муромцев» состояли из 7–8 человек. Вооружение «сверхкрепости» – два «Виккерса», три «Льюиса» и три «Мадсена». Осенью 1917 г. в мастерских Эскадры была проведена доработка бомбардировщиков «Илья Муромец»-Е. Их оборудовали присланными с «Руссобалта» новыми хвостовыми оперениями, подобными используемому на типе Г-2бис, т. е. с двумя рулями направления и открытой хвостовой пулеметной точкой.
Вместо законсервированной серии «Д» осенью 1916 г. на «Авиабалте» заложили десять воздушных кораблей уже более-менее доведенной модификации Г-2 (№ 236–245). Однако им также не удалось избежать столь традиционных для «Муромцев» переделок, и самолеты вскоре получили новое обозначение – Г-3. Два больших, разделенных на секции топливных бака были установлены не в центроплане, а над корневыми участками крыльев. Под баками обшивка была защищена алюминиевыми листами. В центроплане же осталась только огневая точка для стрельбы вперед из пулемета «Льюис». Пулеметная установка для стрельбы назад-вверх вернулась на свое прежнее место сверху фюзеляжа, которое занимала на «Б». Там крепился станковый пулемет типа «Виккерс» или «Кольт». Такой же пулемет или «Льюис» находился в хвостовой установке. Кроме того, на ИМ-Г-3, как и на Г-2бис, предусматривалась «кинжальная установка». Экипаж состоял из шести человек – пилот, его помощник, артиллерийский офицер, младший механик и два моториста-стрелка. Разнесенное хвостовое оперение осталось «двухрулевым», но отличалось от предыдущих модификаций не только формой, но и увеличенной на 4 кв. м площадью стабилизатора.