Несущий на себе основную тяжесть войны Западный фронт ПВО к июню 1943 года включал в себя Особую московскую армию ПВО, 11 корпусных и дивизионных ПВО и 14 соединений истребительной авиации ПВО. В нем имелось 1012 пилотов-истребителей, 3106 зенитных орудий среднего калибра и 1066 орудий малого калибра, 2280 зенитных пулеметов, 1573 зенитных прожектора и 1834 аэростатных заграждения.64 Менее значимый Восточный фронт ПВО, который обеспечивал защиту жизненно важных объектов на Урале, Средней и Нижней Волге, на Кавказе и в Закавказье, состоял из Закавказской зоны ПВО, семи корпусных и бригадных районов ПВО и восьми соединений истребительной авиации; он имел 447 пилотов-истребителей, 2459 зенитных орудий среднего калибра и 800 орудий малого калибра, 1142 зенитных прожектора, 1814 зенитных пулеметов и 491 аэростат заграждения.65
Для улучшения управления войсками ПВО во время стратегических операций – таких, как оборона Курска – Центральный штаб ПВО страны часто учреждал специальные группировки сил ПВО. Например, в Курске он учредил оперативную группу войск ПВО под руководством полковника В. С. Гаврилова, начальника штаба Воронежского корпусного района ПВО. Эта группа централизовала управление войсками ПВО, защищавшими Курск и примыкающие к нему железнодорожные ветки, координировала действия сил ПВО страны и войсковых ПВО в данном районе, поддерживала тесную связь со штабами ПВО, защищавшими Центральный и Воронежский фронты. Оперативная группа Гаврилова имела под своим началом 761 зенитное орудие, свыше 200 истребителей, 558 зенитных пулеметов и 125 зенитных прожекторов.66
В сочетании с огромным количеством нового вооружения и техники, полученным войсками ПВО в 1943 году эти улучшения управления значительно увеличили возможности ПВО в деле обнаружения и уничтожения неприятельских воздушных целей. Однако упразднение единого командующего всеми войсками ПВО было ошибкой, так как это увеличило груз работы, взваленный на плечи командующего артиллерией Красной Армии, и затруднило ему координацию действий огромной структуры воздушной обороны. Это отсутствие единого командующего также вызвало необходимость в дальнейших изменениях структуры ПВО в 1944 и 1945 годах.
За первые 30 месяцев войны НКО также были произведены существенные структурные улучшения входящей в ПВО страны системы ВНОС, в частности, сформированы новые дивизии ВНОС и отдельные радио-роты. Оперативные улучшения заключались в увеличении числа радиолокационных станций ВНОС. К середине 1943 года эти станции стали главными средствами раннего предупреждения, и ПВО все в большей степени использовала свои посты визуального наблюдения для формирования густой сети наблюдения на подходах к жизненно важным объектам возможной бомбежки.67