Уже 18 декабря японцы оккупировали порт Мири, и с этого момента судьба Борнео с его нефтепромыслами была по-существу решена. В тот же день удар японских морских бомбардировщиков испытали и советские моряки. Находившийся на переходе из Владивостока в Сурабаю сухогруз «Перекоп» (2493 бр.т) у побережья острова Борнео на закате был атакован 26 G3M из состава авиагруппы «Михоро». В результате бомбежки, судно получило тяжелые повреждения от близких разрывов авиабомб и загорелось. Остановить распространение огня не удалось и экипаж оставил корабль. Надо отметить, что на этот раз японские экипажи довольно скромно оценили свой успех, заявив о потоплении 1500-тонного судна.
Если вялые попытки сопротивления сухопутных войск противника у японского командования особого беспокойства не вызывали, то активность голландского флота адмиралов все же настораживала. Об этом можно судить на основании хотя бы того факта, что когда 20 декабря у северо-западного побережья Борнео, в районе Кучинга голландская подлодка потопила японский эсминец «Уранами», 26 бомбардировщиков G4M из состава авиагруппы «Каноя» тщетно до самой темноты патрулировали этот район в поисках субмарин. Не повезло в то день и экипажам девяти G3M из состава авиагруппы «Гензан», которые ни разу не попали в 5000-тонный транспорт.
Между тем, посчитав, что дислокация сил морской базовой авиации уже не отвечает требованиям сложившейся обстановки, японское командование 21 декабря отдало приказ о переброске на острова Палау и Пелелиу 21-й авиафлотилии (1 -я авиагруппа, «Каноя», «Такао» и «Токо»), усиленной истребителями «Зеро» из состава 3-й авиагруппы. С этой позиции данная группировка могла эффективно поддерживать операции японского флота в районе Южных морей и оказывать давление на Новою Гвинею и Северную Австралию, а также парировать возможные удары американского флота со стороны Гавайских островов.
Не задерживались на основных аэродромах и экипажи 23-й авиафлотилии. Например, на следующий день, 22 декабря, две эскадрильи (18 G3M) из состава авиагруппы «Михоро» вместе с 15 «Зеро» перебросили на захваченный аэродром Мири, откуда во второй половине дня эта группа нанесла удар по голландской авиабазе Сингкаванг II, где находились бомбардировщики «Мартин»! 39. В ходе налета на стоянках сгорели два самолета и были перепаханы рулежные дорожки. Затем последовал удар еще 24 самолетов из состава авиагруппы «Михоро», вылетевших с авиабазы Ту Дау Мой, в результате которого были уничтожены семь машин из десяти уцелевших. 24 декабря аэродром Сингкаванг II подвергся еще двум налетам. Сначала его атаковали 18 G4M из состава авиагруппы «Каноя», а затем семь «троек» в сопровождении шести «Зеро», взлетевших с Мири. После этого на нем уже не осталось ничего, представлявшего хоть какую-то ценность для обороняющихся.