К сожалению, в системе Министерства связи эксплуатация новой материальной части не была организована надлежащим образом. Большинство аэросаней «Север-2» поступило в подразделения связи, не имевшие необходимой инфраструктуры (не было соответствующего оборудования и утепленных помещений для профилактического обслуживания и ремонта). В лучшем случае аэросани попадали в примитивно оборудованные автотранспортные конторы связи, где их хранение в период навигации и в летнее время осуществлялось под открытым небом. Не всегда своевременно доставлялись авиационные ГСМ. Кроме того, большое рассредоточение машин по районам эксплуатации затрудняло их техническое сопровождение и привлечение специалистов КБ и завода-изготовителя для гарантийного обслуживания и консультаций.
Низкая культура эксплуатации конструктивно сложной техники (а аэросани относятся к аппаратам авиационного класса) в сочетании с серьезными дефектами (слабость подвесок и низкая прочность автомобильных кузовов, не выдерживавших эксплуатационных нагрузок) привели к массовому выходу аэросаней «Север-2» из строя в эксплуатирующих подразделениях. Характерным в этом отношении может служить опыт эксплуатации аэросаней в Якутске, где средний пробег на машину за четыре зимних сезона до момента списания составлял 13976 км.
Распределение аэросаней «Север-2» по управлениям связи
| (Управление связи | 1960 | 1961 | Всего |
| Хабаровское | 10 | 10 | 20 |
| Якутское | 5 | 5 | 10 |
| Томское | 5 | — | 5 |
| (Тюменское | 6 | 3 | 9 |
| IАрхангельское | 4 | 3 | 7 |
| (Свердловское | — | 3 | 3 |
| Алтайское | — | 3 | 3 |
| [Иркутское | — | 3 | 3 |
| [Башкирское | — | 2 | 2 |
| [Магаданское | 2 | — | 2 |
| Мурманское | — | 3 | 3 |
| [Вологодское | — | 3 | 3 |
| Омское | — | 5 | 5 |
| Камчатское | 6 | — | 6 |
| Амурское | 2 | — | 2 |
| Оренбургское | 4 | 3 | 7 |
| Коми АССР | 5 | — | 5 |
| Акмолинское | — | 1 | 1 |
| Кустанайское | - | 1 | 1 |
Вместе с тем, в ряде мест эти аэросани эксплуатировались вполне успешно. Например, в Хабаровском управлении связи последовательно расширяли диапазон использования аэросаней и добились неплохих результатов. Одним из лучших подразделений, эксплуатировавших аэросани, была Комсомольская-на-Амуре транспортная контора(руководитель – С.И. Богоявленский). Девять серийных машин первой и второй серий (пробег опытовых саней №0203 в статистику не включался) с начала их эксплуатации зимой 1960-1961 г. и до сезона 1963-1964 гг. прошли в общей сложности 411449 км. В этой конторе обеспечили быструю регулярную доставку почтовых отправлений в течение всего зимнего (навигационного) периода. По итогам эксплуатации средняя продолжительность навигации составляла 3,5 месяца, а средняя продолжительность эксплуатации в течение одного навигационного месяца – 22 дня. Средняя техническая скорость аэросаней «Север-2» равнялась 37-40 км/ч, а коммерческая скорость с учетом остановок для обмена почты – 26-30 км/ч. Средняя коммерческая нагрузка находилась в пределах 350-500 кг. Среднесуточный пробег- 150-200 км.