Специфика работы двигателей, не позволяла управлять их тягой, как обычно, по «истребительному». Практика «педаль в пол» для новой двигательной установки теряла смысл. Разгонялись они очень медленно, поэтому в результате подобных действий пилот попадал под огонь истребителей союзников, либо ему приходилось выпрыгивать с парашютом из-за аварии чрезвычайно форсированных двигателей Jumo 004. Трехопорное шасси с передней стойкой, так же требовало привыкания. Большая скорость, которой можно было достичь на Ме-262, могла представлять для пилота, как преимущество, так и проблемы.
На начальной стадии использования самолета в боевых частях произошло много аварий связанных с ошибками пилотов. Их количество составляло около 20 % от всех катастроф, что было относительно низким показателем, для такой совершенно новой машины. Причины более чем 60 % происшествий распределялись между двигателями и шасси, а остальные несколько десятков процентов приходились на различные другие технические причины. Несмотря на то, что почти одна пятая часть катастроф происходила по вине пилотов, оказалось, что большей части из них можно было бы избежать, если бы пилоты были лучше подготовлены. «Швальбе» был не просто очередным истребителем, который поступил на вооружение — это была совершенно новая машина. Обращению с ней необходимо было научить.
Находясь в кабине одноместного Ме-262 пилот оставался с самолетом один на один. И его поджидали многочисленные неожиданности. Тренировки «на берегу» перед его первым вылетом, конечно, были необходимы, но научиться летать, таким способом было невозможно. Чтобы научиться плавать, нужно зайти в воду. Пилот, в конце концов, должен был стартовать и совершить самостоятельный вылет. Необходимо помнить о том, что шла война, и драматически развертывавшиеся для Германии события не располагали к интенсивному, всестороннему обучению. Новые пилоты были необходимы сию же минуту. Чтобы облегчить и сделать более эффективным процесс переучивания пилотов на новую машину, была создана ее двухместная модификация, которая позволяла производить полет под руководством опытного инструктора, который мог корректировать ошибки ученика.
Программа переучивания пилотов на Ме-262 проводилась первоначально в Erpobungskommando 262 в Лехфельде, а затем в III Erganzungsgruppe JG 2. Здесь была разработана целая система, позволяющая ученику через самое короткое время производить полеты на «Швальбе». На первой фазе обучения, каждый курсант должен был отлетать 20 часов на поршневых Bf-110 и Ме-410. При этом дросселя блокировались в одном положении, что симулировало технику управления тягой двигателями Jumo 004. Когда ученик овладевал этим искусством, он пересаживался на Ме-262, но не вылетал на нем сразу, а в течение трех дней получал теоретические знания по предмету функционирования и обслуживания реактивного двигателя, и знакомился с кабиной. В Лехфельде находился так же специальный тренажер, представлявший собой попросту лишенный крыльев «Швальбе». Прибывающие пилоты-реактивщики обучались на нем обслуживанию рулевых устройств.