Чтобы более весомо противостоять королю Сигизмунду III Россия все 90-е годы XVI в. вела переговоры с Германской империей о совместных действиях. В 1590 г. был отпущен поляками на свободу эрцгерцог Максимилиан, который, естественно, желал отомстить своим обидчикам. Стороны долгое время хитрили, пытаясь оговорить для себя особые условия, поэтому никаких совместных действий против Республики они так и не предприняли, а затем переключились на создание коалиции против Оттоманской империи. При этом когда императорский посол, бургграф донавский Авраам, просил Бориса Годунова от имени императора Рудольфа II защитить Венгрию от нападений крымского хана через Карпаты, тот ответил: «У великого государя рати много, можно ему Рудольфа цесаря оборонять от недругов: только бы дал дорогу нашей рати король польский через Литовскую и Польскую земли рекою Днепром; тогда государь послал бы на крымскую рать свою плавную, а из Северской земли послал бы рать конную, и крымскому от такой рати где было бы деться? Не стало бы крымского царя ни на один час» [68, 327]. Правда, что при этом осталось бы от Польско-Литовской республики, Борис Годунов не стал обсуждать с императором, ну а король Сигизмунд III такого разрешения, конечно, не дал бы.
К 1596 г. в Польско-Литовской республике созрели плоды просветительской работы ордена иезуитов, создававших в стране бесплатные школы для всех желающих, а также проводивших индивидуальную работу со многими представителями литовской православной знати. В 1579 г. усилиями иезуита Петра Скарги, в миру Петра Повеньского, была создана Виленская иезуитская академия, позднее ставшая Вильнюсским университетом. Для католической Польши и в основном православной Литвы к концу XVI в. иезуитами были созданы условия и понимание сторон необходимости соединения церквей. Одним из аргументов в пользу унии было и то, что константинопольских патриархов, которые окормляли литовскую и русинскую паству, ставил на патриарший престол турецкий султан. Не желали литовцы и русины принадлежать и московской православной церкви, патриарх которой стал называть себя «патриархом всея Руси». Литовская и русинская знать в случае унии церквей рассчитывали на приобретение большего веса и представительства в сенате Республики. Немаловажным было и то, что это единение могло укрепить верующих в лоне традиционных конфессий и удержать их от перехода в различные протестантские течения.
Собор православных церквей Литвы и Польши по вопросу заключения унии с католической церковью был открыт королем Сигизмундом III в Бресте осенью 1594 г. За соединение церквей на соборе выступили многие иерархи православной церкви, в том числе и митрополит киевский и галицкий Михаил Рагоза, епископ львовский и каменец-подольский Гедеон Балабан, епископ пинский Леонтий, епископ брестский и владимирский Ипатий Потей, епископ луцкий и острожский Кирилл Терлецкий, епископ полоцкий и витебский Герман Хребтович, епископ холмский и белзский Дионисий Збируйский.