26 февраля 2010 года около половины пятого вечера в коридорах мэрии Смоленска появились некие «люди в штатском». Они окружили Эдуарда Качановского, который только что вышел с совещания по вопросам развития жилищно-коммунального хозяйства, и попросили мэра следовать с ними. В это время в кабинетах мэрии уже начались обыски и процедура выемки документов. Самого Качановского доставили в здание прокуратуры Смоленской области.
В чем конкретно обвиняют мэра, его заместителя Валерия Осипова и охранника Романа Максимова, стало известно лишь на следующее утро. По версии следствия, Качановский и его заместитель вымогали у директора строительной организации взятку в виде трехкомнатной квартиры стоимостью более двух миллионов рублей в новом доме номер 9 по улице 25 сентября, угрожая в противном случае не выдать разрешение на ввод здания в эксплуатацию. Как говорилось в материалах следствия, охранник Роман Максимов был задержан непосредственно после передачи в Регистрационную палату справки от строительной организации о том, что она не имеет финансовых претензий на трехкомнатную квартиру и недвижимость может быть оформлена на имя Максимова, хотя фактически никакой оплаты за квартиру не проводилось.
Заместитель главы города Наталья Алексеевна Зверева сообщила журналистам, что, по версии следствия, вымогательство происходило в течение декабря 2009 — февраля 2010 года, тогда как разрешение на ввод в эксплуатацию злополучного дома, датированное декабрем 2009 года, на тот момент уже было подписано и выдано фирме-застройщику. Следовательно, и шантажировать строительную компанию Качановскому было попросту нечем! На брифинге для журналистов супруга мэра Светлана Качановская, не скрывая отчаяния, говорила: «Этот человек никогда не мог разменяться на какую-то трехкомнатную квартиру. Муж всегда был честным человеком. Мне непонятно, по какой причине он задержан. Муж очень много работал, практически не бывал в семье: уходил в шесть утра, возвращался в три часа ночи. Понимаете, я, как жена, его практически не видела! Все вы помните, как Эдуард Качановский начинал свою политическую карьеру, как его облили кислотой».
Тем временем в городе организовывались пикеты под лозунгами «Вернем Смоленску Качановского!». Жители города собрали две тысячи подписей под обращением к федеральным властям с просьбой взять под контроль расследование уголовного дела.
По одной из версий, Эдуард Качановский пал жертвой грядущего юбилея Смоленска. Для подготовки 1150-летия города было выделено в общей сложности шестнадцать с половиной миллиардов рублей — эта сумма в четыре раза превышает годовой бюджет Смоленска.