Уже после войны многие годы чекисты искали и находили кровавых пособников гитлеровцев, карателей.
Тысячи бывших военнопленных возвращались на Родину. Возвращались и бежавшие с немцами, и угнанные в Германию на работу. И выявить среди них вражескую агентуру, тех, кто служил в РОА («Русская освободительная армия»), пособников нацистов, лиц, служивших в полиции, бывших старост и сотрудников оккупационной администрации предстояло СМЕРШу.
В 1946 году Главное управление контрразведки СМЕРШ было включено в Министерство государственной безопасности СССР на правах 3-го управления.
СМЕРШ блестяще выполнил возложенную на него задачу.
Свидетелей и участников событий того давнего времени сегодня осталось очень мало.
СМИ не очень распространяются о делах и людях СМЕРШа. Во время одной из встреч автора с молодыми офицерами СВР запомнилось их уважительное отношение к СМЕРШу. Стало быть, эту структуру чтут, традиции СМЕРШа живут. Эпоха СМЕРШа оставила заметный след в истории отечественной контрразведки.
В соответствии с Указом Президиума Верховного Совета СССР от 4 мая 1946 года ГУКР СМЕРШ Министерства Вооруженных сил СССР было передано в состав МГБ СССР и получило название 3-го Главного управления. Начальник ГУКР СМЕРШ генерал-полковник B. C. Абакумов сменил на посту министра госбезопасности В. Н. Меркулова. С момента утраты своей самостоятельности и передачи в МГБ легендарный СМЕРШ прекратил свое существование. Постепенно военная контрразведка, как и в старые времена, стала следить за лояльностью военнослужащих к существующему государственному строю. Во второй половине сороковых – первой половине пятидесятых годов прошлого века происходили регулярные кадровые перестановки. Вместе с начальниками своих постов лишались и их подчиненные. Приходили новые люди. По-разному сложились судьбы руководителей СМЕРШа. Некоторые в связи с арестом B. C. Абакумова оказались в заключении: Селивановский Н. И., Королев Н. А.[24], Белкин М. И.[25] и другие. Они проходили по «делу Абакумова». Мешик П. Я.[26], Рухадзе Н. М.[27] – расстреляны… Генерал-майор Сиднев Алексей Матвеевич[28], бывший начальник СМЕРШа Карельского фронта, а затем заместитель начальника СМЕРШа 1-го Украинского фронта, стал министром госбезопасности Татарской АССР, но на этом посту пробыл недолго – был арестован за «увлечение трофеями». Были вскрыты крупные хищения вещей и золота, в которых он принимал непосредственное участие. Вадис А. А. был исключен из КПСС и лишен генеральского звания. Были уволены и лишены своих званий Быстров А. С., Зеленин П. В.