В 1814 году с маленькой дочерью Эмма бежит из Англии во Францию. Горькая ирония судьбы: гражданская жена и дочь первого героя Англии ищут спасения от соотечественников в стране, против которой так долго и успешно сражался их муж и отец!
Последний год жизни Эмма провела в портовом городке Кале, мимо которого столько раз в гуле парусов и грохоте пушек проносились победоносные эскадры того, кто любил ее больше всего на свете. Некоторое время Эмма с Горацией снимала номер в местной гостинице, а когда кончились последние деньги, перебралась в скромный домик на пригородной ферме. В местной лавке она покупала самое дешевое мясо, которое обычно шло на корм собакам, а зачастую не могла купить и его. Жизнь уходила, для бывшей красавицы все уже было в прошлом. Очевидцы рассказывали, что последние дни своей жизни Эмма провела в воспоминаниях о Нельсоне, беспрестанно перебирая те немногие его вещи, которые у нее остались: несколько колец, пара медальонов, прядь его волос, а также ее собственный портрет, который Нельсон всегда держал в своей каюте. Все эти вещи в свое время вместе с последним письмом вице-адмирала привез ей капитан «Виктори» Харди. Теперь в конце этого последнего письма плачущая Эмма написала: «О бедная, несчастная Эмма! О счастливый, овеянный славой Нельсон!»
Опустившаяся, выглядевшая намного старше своих пятидесяти лет, она умерла в январе 1815 года, сжимая в руках портрет Нельсона. Перед смертью Эмма написала трогательное прошение, умоляя похоронить ее рядом с Нельсоном. Надеялась ли она, что кто-то в Англии исполнит ее последнюю отчаянную просьбу? Разумеется, никто это прошение серьезно не воспринял. Эмму Гамильтон похоронили на окраине Кале в безымянной могиле. Один из биографов Нельсона удивительно точно сказал о судьбе двух его самых близких женщин: «Нельсон разбил Эмме сердце своей смертью. Он же разбил сердце Фанни своей жизнью».
Маленькую Горацию после смерти матери взяла на воспитание одна из сестер Нельсона. В семье героя Трафальгара прекрасно знали, кем является Горация, а потому отношение к ней всегда было прекрасным. Впоследствии Горация вышла замуж за деревенского священника. Некоторые историки считают, что она до конца своих дней так и не узнала, кто является ее настоящим отцом. Возможно, так и было, ибо интимная переписка Нельсона с леди Гамильтон, где говорится об отцовстве Нельсона, была опубликована спустя много лет после смерти Горации. Английский биограф Нельсона Г. Эджингтон пишет, что на могильном камне Горации имелась надпись: «Приемная дочь вице-адмирала лорда Нельсона». Позднее кто-то перечеркнул слово «приемная» и вместо него начертал на камне слово «любимая».