21 октября скоростной истребитель И-28 был осмотрен руководством НКАП, НКО и командованием ВВС КА. Между тем с 19 числа возобновились полеты, правда, выполнению программы летных испытаний препятствовал изменившийся в худшую сторону температурный режим мотора М-87Б, особенно сильно перегревались 3-й и 1-й цилиндры. По этой причине 24 октября главный конструктор и ведущие инженеры приняли решение снять кожух кольцевого маслорадиатора. Кроме этого неоднократной доработке подвергали дефлекторы цилиндров. Однако проблема с перегревом мотора продолжала преследовать испытателей. Для ее решения подключили специалистов 8-го отдела НИИ ВВС КА.
К 11 ноября температурный режим М-87Б удалось несколько улучшить. В этот день после опробования П.М. Стефановским винтомоторной группы в воздухе и снятия температурных характеристик на «дублере» первый ознакомительный полет выполнил летчик-испытатель старший лейтенант А.Г. Кубышкин. С 12 ноября начались полеты по программе испытаний: снятие максимальных скоростей по высотам, оценка скороподъемности, маневренности, управляемости и т.п.
С целью доведения температурного режима до требуемых норм, 17 ноября на совещании, проведенном с участием специалистов 1-го ГУ НКАП, ЦАГИ и НИИ ВВС КА, по рекомендации профессора В.И. Поликовского приняли решение увеличить выходное отверстие маслорадиатора до 50% от его фронта. Полеты возобновились 23 числа после соответствующей доработки маслосистемы и устранения причин запаздывания уборки правой опоры шасси.
В декабре дал знать о себе капот. И числа после полета на скороподъемность и снятия максимальных скоростей по высотам до 8000 м обнаружили начало разрушения нижней части капота с всасывающим патрубком. В течение следующего дня на заводе №81 провели усиление нижнего сегмента капота и 13 декабря его установили на машину. А через два дня совместно с профессором ЦАГИ Е.А. Покровским была рассмотрена программа испытаний на штопор. Однако выполнить намеченное не удалось.
16 декабря И-28 потерпел аварию. В этот день полетное задание предусматривало замер скороподъемности и скорости по высотам до 6500 м. Старший лейтенант А.Г. Кубышкин задание выполнил, но при возвращении из-за потери ориентировки заблудился. В результате ему пришлось совершить вынужденную посадку на аэродроме Тушино. Так как горючее было на исходе, летчик не успел выпустить шасси и посадил машину на фюзеляж. Однако благодаря умелым действиям А.Г. Кубышкина, а также достаточной прочности конструкции самолета, И-28 получил незначительные повреждения: был погнут винт и немного помята нижняя обшивка капота и правой консоли крыла. Сам летчик не пострадал. Для проведения восстановительных работ 18 декабря машину отправили на завод №81.