В октябре 1942-го ГРУ было переподчинено исключительно наркому обороны. В задачи главного управления входила организация агентурной и разведывательно-диверсионной работы как на территории иностранных государств, так и на оккупированных советских территориях.
Кроме того, в Генеральном штабе было создано Управление войсковой разведки, но оперативно-агентурная работа выходила за рамки компетенции этой структуры.
А 19 апреля 1943 года из особых отделов НКВД, занимавшихся противодействием массированной заброске агентуры спецслужб противника, было создано легендарное управление военной контрразведки СМЕРШ. К моменту образования контрразведки инициатива в ведении военных действий стала постепенно переходить к войскам РККА, в копилке наших войск была позади битва под Сталинградом.
Считается, что название этой спецслужбе дал сам Сталин. Вначале это подразделение предлагалось назвать СМЕРНЕШ (то есть «смерть немецким шпионам»), на что Сталин заявил, что на советской территории полно шпионов и из других государств, с которыми также необходимо вести борьбу. Поэтому официальным наименованием нового органа стало управление контрразведки СМЕРШ НКВД СССР. Документов, подтверждающих историю этого названия, на данный момент не имеется. Тем не менее такая легенда существует.
Вообще были образованы три независимые структуры: Главное управление контрразведки СМЕРШ Народного комиссариата обороны СССР, которое возглавил В. С. Абакумов; Управление контрразведки СМЕРШ Народного комиссариата Военно-морского флота СССР под руководством П. А. Гладкова; Отдел контрразведки (ОКР) СМЕРШ НКВД СССР, начальником которого стал С. П. Юхимович.
Основной задачей службы контрразведки являлась борьба со шпионской, диверсионной, террористической и иной подрывной деятельностью иностранных разведок в частях Красной армии и ВМФ, а также в тылу. Эта работа была направлена как на профессиональных немецких разведчиков и диверсантов, прошедших длительную подготовку, так и на завербованных агентов.
Напомню, что в первые недели войны в немецкий плен попало огромное количество советских военнослужащих, из числа которых подбирались люди, соглашавшиеся на сотрудничество с вермахтом. Затем они направлялись в советский тыл прежде всего для сбора разведывательной информации.
Однако готовность военнопленных поступить на службу к вермахту была обусловлена отнюдь не ненавистью к товарищу Сталину, как сегодня можно прочитать у ряда исторических публицистов. Большинство красноармейцев попадали в плен в силу трагически сложившихся обстоятельств, когда в результате стремительного продвижения германских войск в окружении оказывались целые армии. Поэтому говорить о том, что все они сдавались из-за желания противостоять советскому строю, будет по меньшей мере преувеличением.