При Богдане Хмельницком Гетманщина-Украина имела две столицы — Киев и Чигирин — и войсковую штаб-квартиру в Белой Церкви и была разделена на полковые города и сотенные местечки с селами, ставшими административно-военными округами, которые удачно заменили воеводства и поветы Речи Посполитой. Все приказы гетмана быстро доходили до всех полков, сотен, куреней и мгновенно исполнялись. Доходы Гетманщины, шедшие в том числе и на войско, складывались из налогов на торговлю, промыслы, ремесла и распределения земельного фонда.
В 1649 году Богдан Хмельницкий начал чеканить первые украинские монеты, о чем царю докладывал посол Кунаков: «В Чигирине учинил Богдан Хмельницкий мынзу, и деньги делают, а на тех новых деньгах на одной стороне сабля, а на другой — его Богданово имя». Гетман Станислав Потоцкий в октябре 1652 года писал королю Яну Казимиру: «Хмельницкий вмешивается во власть Вашей Королевской Милости, чеканит деньги». 21 декабря 1652 года «Gazette de France», основанная герцогом Арманом де Ришелье, сообщала Европе: «Казацкий гетман начал чеканить на Украине собственные монеты, чем вызвал протест польского короля».
Высшее православное духовенство в Киеве во главе с митрополитом Сильвестром Косовым, которое Богдан щедро одаривал землями, льготами и вкладами, относилось к нему враждебно как к вождю всех украинцев, не делившему их на богатых и бедных. Косов поддерживал связи с польскими магнатами, в 1651 году сдал Киев литовскому войску гетмана Радзивилла, разорившему и спалившему город, делал и другие дела, вредившие гетману и державе. Богдан терпел, пока мог, но затем написал Косову: «Ты, отец митрополит, если в наших делах не будешь стоять против ляхов и станешь что-нибудь делать против моей воли — то будешь в Днепре!». Косов сквозь зубы признал создание Украины, но только на словах, в делах продолжая вредить Богдану.
Митрополит Косов хотел наложить руку на все церковные приходы, включая униатские, и в 1649 году Богдан еще раз попытался объяснить неуемному иерарху, что такое государство: «Непристойное и тяжкое дело, когда кто-то заставляет применять силу к нежелающим принять его веру, заставляет, как и кто должен веровать. Это было издавна и аж до самого нашего времени! Больше мы не хотим быть тяжкими униатам, пусть они верят так, как хотят». Гетману только еще не хватало наряду со страшной польской, литовской и татарской угрозой восстановить против создателей украинского государства половину его населения. Создавать великолепную Украину Богдану Великому не давали чужие и мешали свои. Нема ума — считай калика. Таких калик среди высшего руководства молодой державы было полным полно.