Через сутки в город въехал и царь, заквартировав в доме местного сотника, имея намерение казнить несколько десятков горожан за то, что принимали у себя сердюков, для острастки жителей других городов, чтобы они также не принимали вражеских войск. Однако присутствующий при этом граф Шереметьев заступился за горожан, доказывая царю, что «если ваше величество, зная больше Мазепу, чем этот народ его знал, могли в нем обмануться, доверяя ему почти безгранично, то как же в нем не обмануться народу, далекому от всех политических и властных дел, которые для него всегда закрыты и непроницаемые? А Мазепа, к тому же, был для них наивысшим начальником и не отчитывался перед ними за свои действия». Царь прислушался к таким разумным словам, и на счастье при этом не было Меншикова, и простил горожан. Наградил урядников, которые способствовали взятию города: сотник Журавка стал стародубским полковником, а протопоп Лисовский стал новгородским сотником и, с добавлением протопопа, по воскресеньям правил в церкви в епитрахили, а в другие дни служил сотником с саблей, но бороды при этом не брил.
Король шведский, выступив с армией из Польши в Малороссию, нашел Мазепу возле реки Десны в пределах Новгород-Северского. Увидев его без войска и без всего того, что он ему обещал, решил, что он обманщик или предатель и намеревался его казнить. Но убедительные жалобы Мазепы и искренние его рыдания убедили короля, что Мазепа сам был обманут своим войском и своим народом.
Вступив в Малороссию, Карл XII распространял в ней, публично выставляя, свои прокламации к местному населению такого содержания: «Преследуя злобного своего врага, царя московского, который наслал на Швецию со всех сторон войну без всяких причин, а только из-за своей злости и чванства, я вступаю в землю казацкую не ради завоевания ее или попользоваться имуществом и скарбами здешних жителей, но единственно ради восстановления их прав и бывших вольностей, ради которых мои предки, шведские короли, всегда выступали в защиту против Польши и к тому были обязаны важными заслугами казаков и союзными с ними договорами и трактатами. Мне известно от соседей и протеста гетмана Мазепы, что царь московский, будучи непримиримым врагом всем народам на свете и желая покорить их себе в неволю, заключив и казаков в беспросветное рабство, пренебрегая, отбирая и отменяя все ваши права и вольности, торжественными с вами договорами и трактатами утвержденными, забыл при этом и бесстыдно пренебрег саму благодарность, уважаемую всеми народами, которой обязаны он и Московия вам, казакам и народу русскому, сведенная своими междоусобицами, самозванцами и поляками до нищеты и почти до исчезновения, но вами поддержанная и укрепленная. Известно ведь всему свету, что народ русский со своими казаками был сначала народом самодержавным, то есть от себя самого зависимым, под управлением своих князей, соединился потом с Литвой и Польшей, чтобы сопротивляться с ними татарам, которые их разрушали, но со временем из-за насилия и жестокости поляков, освободившись от них собственными силами и храбростью, соединился с Московией добровольно только из-за единоверия, сделав ее такой, какой она теперь есть, от нее же униженный и оскорбляемый бессовестно и бессрамно. И так я обещаю и перед всем миром торжественно присягаю честью своею королевской после победы над своим врагом восстановить землю казацкую, или Русскую, в первоначальном ее самодержавном состоянии и ни от кого в мире не зависимой, о чем я с гетманом Мазепой письменными актами обязался и утвердил, а гарантировать их взяли на себя первые государства Европы».