В этот период здесь был сооружен прекрасный памятник древнего зодчества — здание церкви Симона Канонита. Впоследствии она становится епископской кафедрой, именовавшейся Цхумской. Среди сорока епархий Грузии Анакопийская играла видную роль.
Здание церкви служило также местом погребения духовных особ Цхумской епархии. На одном из камней алтарной стены сохранилась греческая надпись о погребении, относящаяся к греческой эпохе Анакопии.
Церковь Симона Канонита
Церковь несколько раз восстанавливалась. В 1882 году, во время последнего капитального ремонта церкви, в ней была найдена монета эпохи Алексея Комнина. Следовательно, перед этим храм обновлялся при грузинском царе Давиде (1089–1130). Церковь в тот период была богато украшена стенной росписью.
В эпоху феодальной раздробленности Грузии (XIV–XVII века) Анакопия утрачивает свое политическое и экономическое значение. Некогда многолюдный портовый и административный город опустел. Грузинский историк Вахуштий Багратиони с горечью сообщал в середине XVIII века, что Анакопия, прежде представлявшая собой город благоустроенный и прекрасный, построенный над берегом моря и особенно возвеличенный (царями) Багратионами, теперь запущен.
На карте Западной Грузии, составленной тем же Вахуштием, развалины Анакопии отмечены как место, покинутое населением. Во время турецкой оккупации там находился только турецкий гарнизон, разместившийся на Апсарской горе. Время от времени турки совершали опустошительные набеги на окрестные абхазские села.
Итак, ко второй половине XVIII века Анакопия как город перестал существовать. Остались лишь развалины, заросшие густым лесом.
Позднее эта местность, называемая Псырцха (по-абхазски «Пихтовый родник»), принадлежала абхазским феодалам Маан. Один из представителей этой фамилии, некий Хасан, считал себя полновластным хозяином Псырцха и долгое время занимался разбоем и разрушением памятников старины.
После присоединения Абхазии к России на Абхазском побережье возникают новые населенные пункты, развивается торговля. Псырцха же на протяжении первой половины XIX века остается небольшим заброшенным поселением.
Жизнь вновь забурлила здесь после основания Ново-Афонского монастыря. История его создания такова. Чтобы укрепить свои позиции на Кавказе, царизм активно проводит здесь церковную колонизацию. В частности, царское правительство решило обратить в христианство ту часть абхазского населения, которой турки в свое время навязали ислам суннитского толка[33].
Большую помощь царскому правительству оказали русские монахи из Пантелеймоновского монастыря Старого Афона. Пантелеймоновский монастырь был основан еще в 1080 году при Алексее Комнине в районе греческого монашеского государства, которое находилось на гористом и лесистом полуострове Агион Орос в Эгейском море на восточном выступе Халки донского полуострова. Там были воздвигнуты греческие, русские, а также и грузинские мужские монастыри.