Антоний наконец решается 15 февраля отплыть со вторым эшелоном войск (15 000 чел. и 800 конницы) к берегам Греции. Буря разносит его флотилию и отбрасывает к северу от Дирахиума к Лиссусу, где и высаживается 2-й эшелон. 18 февраля Цезарь узнает об этом и тотчас же решается соединить обе половины своей армии у Тирана (30 верст к востоку от Дирахиума, 70 верст от Апсуса и 50 верст от Лиссуса). Помпей не успел помешать соединению, и Цезарь сосредоточивает у Тирана 35 000 войск.
Теперь обстановка для Цезаря сделалась благоприятнее: у него 35 000 против 50 000—60 000 войск Помпея. В лагере Помпея обсуждался вопрос: что предпринять против Цезаря? Можно было: 1) дать ему сражение, 2) оставить его в Греции и, отплыв в Италию, произвести переворот в пользу аристократической партии, или 3) открыть действия на сообщения Цезаря на суше и флотом на море. Решено остановиться на этом последнем способе действий, и Помпей остается у Дирахиума. Цезарь находился в 40 верстах у Скамитьи. Флот Помпея успевает уничтожить все транспортные суда Цезаря; кавалерия противника стала на его сообщениях. Цезарь посылает отряд Домиция в Фессалию для обеспечения своих сообщений с базою в Аполлонии, со стороны союзников Помпея и войск его, ожидавшихся с востока. Этот отряд овладевает несколькими городами после кровопролитных штурмов, доказавших, что сторонников Цезаря в Фессалии было меньше, чем в Эпире.
Цезарь еще раз попытался вызвать Помпея на бой и двинулся вперед, но тщетно! Тогда он решается отрезать Помпея от Дирахиума, двинувшись через Пеким и Пезу. Это не удается; Помпей заходит в укрепленный лагерь, примыкавший к морю, а сообщение с Дирахиумом сохраняется при посредстве флота. Положение Цезаря становится день ото дня тяжелее: кавалерия Помпея опустошила и без того бедные окрестности и стала на сообщениях армии Цезаря с его базой (Аполлония – Орикум).
Тогда Цезарь решается на дерзкое предприятие; с армией в 22 000 чел. блокировать с сухопутья 50—60-тысячную армию Помпея, еще не потерпевшую ни одной неудачи в поле и притом сохранившую морские сообщения. Для выполнения этого предприятия пришлось построить блокадную линию в 23 версты (25 редутов, соединенных окопами) и занять ее 22 000 войск. При такой растянутости расположения неоднократные вылазки Помпея имели полный успех, но все-таки в его войсках, вследствие скученности расположения и отсутствия пастбищ, начались заразные болезни людей и падеж скота. Цезарь выиграл в том отношении, что, заперев кавалерию противника в лагерь, он получил полную свободу в отношении снабжения довольствием своих войск. Желая ускорить события, Цезарь сделал нападение на Дирахиум, но Помпей произвел в это время сильную вылазку на центр его линий и заставил вернуться назад. Помпей был отбит, но и Дирахиум остался за ним.