На “Блюхере” боковые кили длиной 38,4 м установили в районе с 44-го по 76-й шп. Кили с основанием 450 мм проходили на 300 мм выше центрального киля и параллельно ему.
Внутреннее пространство цельноклепанного корпуса, наверху замыкаемое броневой палубой, включающее обе палубные платформы, от настила внутреннего дна и двойного борта до броневой палубы на крейсерах типа “Шарнхорст” разделили 14-ю водонепроницаемыми поперечными переборками на XV основных водонепроницаемых отсеков, на “Блюхере”, соответственно, 12- ю переборками на XIII отсеков.
Все водонепроницаемые переборки доходили до броневой палубы, а часть из них до батарейной или верхней палуб. По принятому в германском судостроении порядку, нумерация отсеков, а также переборок шла от кормы к носовой оконечности.
На крейсерах типа “Шарнхорст” водонепроницаемые поперечные переборки проходили от внутреннего дна до броневой палубы на 13, 23, 31 1/2, 41, 49, 57, 65, 73, 79, 84, 90, 93, 101 и 109-м шп., на “Блюхере” на 17, 26, 36 1/2, 47, 52, 60, 68, 76, 84, 90, 102 и 109-м шп., имея в нижней части 8-мм толщину, в средней 7-мм и в верхней 6-мм.
На крейсерах типа “Шарнхорст” между броневой и промежуточной палубами водонепроницаемые поперечные 6-мм переборки проходили от ахтерштевня до цитадели на-2, 2, 6, 10, 13-м шп., от цитадели до форштевеня на 93, 95, 99, 104 и 112-м шп., на “Блюхере”, соответственно, на -2, 2, 9,13-м шп. и 102, 106, 113 и 123- м шп. от борта до борта.
На крейсерах типа “Шарнхорст” между промежуточной и батарейной палубами водонепроницаемые поперечные переборки проходили на -2, 6,17 1/2,24 1/2 (цитадель), 31 1/2,41, 49, 57, 65, 82 – 88 1/2 (цитадель), 73, 76, 95,101 и 109-м шп.; но 41, 57, 73 и 76-й шп. были водонепроницаемы только внутри угольных ям над броневой палубой; на батарейной на 6,42, 50, 62, 70,102 и 110-м шп.; на верхней на 23,31 1/2,46,54,58,60 и 102-м шп. На “Блюхере” между промежуточной и батарейной палубами: на – 2,9,36 1/2,47,90,113 и 123-м шп. и совпадали с передней и задней стенками цитадели.
Всё внутреннее пространство корпуса от внутреннего дна и второго борта до броневой палубы вместе с палубными платформами, шпангоутами и стрингерами делилось проходящими в отдельных местах несколькими продольными водонепроницаемыми переборками на более мелкие водонепроницаемые отсеки, помещения и цистерны.
В числе продольных водонепроницаемых переборок на каждом борту корпуса установили по одной 6-мм коффердамной переборке, идущей вдоль двойного борта по высоте от настила внутреннего дна до скоса броневой палубы на крейсерах типа “Шарнхорст” в районе с 13-го по 90-й шп. и образующий между ней и двойным бортом коффердамы (бортовые проходы или коридоры) длиной 92,4 м, на “Блюхере”, соответственно, с 17-го по 102-й шп. длиной 102 м.