6 февраля 1940 г. Черчилль приказал перевести «Куин Элизабет» в более безопасное место, подальше от берегов Англии.
Согласно этому приказу, судно начали готовить к отходу. Сложность состояла еще и в том, что максимальный уровень прилива, необходимый для того, чтобы извлечь гигант из достроечного бассейна и провести его по фарватеру Клайда, должен был наступить еще нескоро — в конце февраля. (Следует отметить, что максимальные значения приливной воды наблюдаются лишь два раза в год, так что если бы «Королева» упустила свой шанс покинуть верфь, ее отход мог задержаться еще не полгода.)
Работа по подготовке судна к выходу в море кипела круглосуточно. Лайнер перекрасили в светло-шаровый цвет, установили систему размагничивания, на борт доставили необходимые припасы и пресную воду. 22 февраля на судно прибыл экипаж военного времени — около 400 человек волонтеров во главе с кэпте- ном Джоном Таунли. А еще два дня спустя судно — без лишней огласки и уж, конечно, без каких бы то ни было торжественных церемоний — было выведено буксирами из достроечного бассейна на фарватер реки. Более часа лайнер не желал разворачиваться носом к устью. Для выполнения этой операции потребовалась помощь нескольких буксиров, чтобы судно, наконец, направилось к морю. Пять часов спустя «Королева» достигла рейда Тэйл-оф-зе-Лэнд в устье Клайда. Там лайнер встал на якоря, а команда в течение четырех дней занималась его подготовкой к первому плаванию: вновь проверялись силовая установка, помпы, навигационные приборы, радиостанция. Провели и шлюпочные учения: восемь шлюпок из 26 были оставлены в Клайдбэнке, остальные проверили на комплектность и легкость спуска. На борт были доставлены топливо и дополнительный запас пресной воды. Несколько человек из экипажа, решившие в конце концов не связывать свою жизнь с судьбой огромного неповоротливого лайнера, могущего в любой момент стать жертвой немецких бомб и торпед, сошли на берег.

Сердце лайнера — машинное отделение
1 марта 1940 г. «Куин Элизабет» покидает Клайдбэнк
Вечером 1 марта 1940 г. судно было полностью готово к выходу в море — в «неопределенный пункт назначения», как значилось в инструкции Адмиралтейства, полученной Таунли. Лишь утром следующего дня капитан получил запечатанный пакет с обозначенным портом назначения — Нью-Йорк. Эскортируемый несколькими британскими эсминцами и бомбардировщиками «Бофорт» лайнер около 8 часов утра развил полный ход и вышел в залив Ферт оф Клайд, после чего Северным проливом, отделяющим Шотландию от Ирландии, проследовал со скоростью 26 узлов в Атлантический океан. В 150 морских милях от побережья графства Донегал эсминцы и самолеты эскорта повернули на свои базы, и «Куин Элизабет» осталась в одиночестве.