Французское командование сделало попытку прощупать силы и возможности русского отряда. Линейный корабль «Женерое» под командованием капитана Лежоаля 27 октября внезапно вышел из гавани и стал сближаться с русским кораблем «Захарнй и Елизавета». Подойдя на дистанцию пушечного выстрела, французский корабль открыл огонь. С русского корабля незамедлительно прозвучали ответные выстрелы, и Лежоаль сразу же повернул обратно. В то же время безуспешно закончилась попытка нескольких французских судов прорваться в крепость: 18-пу-шечный бриг и три транспорта были захвачены русскими кораблями на подходе к острову.
9 ноября 1798 г. к Корфу подошли основные силы эскадры Ф. Ф. Ушакова, а еще через несколько дней прибыл отряд Д. Н. Сенявина. Распределив корабли для несения блокады, Ушаков внимательно ознакомился с положением на самом острове. Рекогносцировка и опрос местных жителей показали, что неприятель занимал только крепость; во всех остальных селениях французских отрядов не было. Ушаков сразу же решил высадить на берег часть своих десантных войск.
Несколько русских кораблей подошли к порту Гуви, расположенному в шести километрах к северу от Корфу. Здесь находился поселок со старой корабельной верфью, но почти все строения и запасы леса были уничтожены и сожжены французами. Тем не менее в -этой гавани русские моряки начали устраивать береговой пункт базирования, где можно было бы ремонтировать корабли.
Чтобы не дать возможности гарнизону Корфу выходить из крепости, грабить близлежащие селения и пополнять запасы продовольствия, русские моряки с помощью местных жителей стали строить батареи и земляные укрепления на острове вблизи крепости. На северном берегу было выбрано место для батареи на холме Монт-Оливето, откуда было удобно обстреливать передовые форты крепости Корфу. Для сооружения батареи с кораблей был высажен десант под командой капитана Кикина, который принялся за установку орудий. За трое суток работа была окончена, и 15 ноября с батареи был открыт сильный огонь по крепости.
Жители селений, расположенных к югу от крепости, просили Ф. Ф. Ушакова дать им несколько пушек для устройства батареи, которая могла бы защищать их селения от набегов французов. Ушаков выделил им три орудия с небольшим отрядом русских артиллеристов. Местные жители соорудили батарею и, не дожидаясь подкреплений с русской эскадры, начали стрельбу по крепости.
Осада Корфу с моря и суши продолжалась свыше трех месяцев. Французское командование, рассчитывая на неприступность -крепости, было уверено в том, что русские моряки не выдержат длительной блокады и вынуждены будут оставить Корфу. Генерал Шабо, изматывая силы осаждающих и держа их в постоянном напряжении, изо дня в день производил вылазки и артиллерийские обстрелы, что требовало от русских моряков постоянной бдительности и готовности к отражению контрударов противника.