В эпоху Юаньскэй династии (1300 годы нашей эры) шла оживленная торговля китайских купцов с Индией, арабским калифатом. Большие мореходные китайские джонки достигали восточных берегов Африки, китайские товары проникали в страны Средиземноморья. За 28 лет, с 1405 по 1433 год, семь китайских экспедиций, по нескольку сот кораблей в каждой, проходили путь от устья Янцзы к островам. Индонезии, к Индии и Аравии, достигали берегов Африки. Корабли водил в далекие моря великий мореплаватель. Чжен Хэ. Большая торговая флотилия китайских джонок плавала вдоль восточноафриканского берега, закупая слоновую кость и леопардовые шкуры, золото и черепаховые панцири, в 1430 году, за 67 лет до появления в этих водах каравелл Васко да Гамы.
В XVI веке в страны Индийского океана начинается проникновение европейцев — сперва португальцев, затем голландцев, позднее французов и англичан. Пионерами в освоении морских путей и овладении Индийским океаном были португальцы, стремившиеся к торговле с богатой, таинственной Индией и к овладению источниками драгоценных тогда пряностей. Португальцы были одновременно и торговцами, и завоевателями, и воинствующими распространителями христианства. Вместе с солдатами каравеллы привозили католических монахов для обращения в христианскую веру всех «язычников». Португальские опорные пункты возникли по всему Индийскому океану — от устья Красного моря до Явы и Молуккских островов. Столицей португальской империи в Индийском океане стала Гоа, которую только в декабре 1961 года индийские вооруженные силы освободили от гнета португальских колонизаторов.
Парусные плавания мореходов различных народов на протяжении столетий позволили хорошо изучить ветры Индийского океана — постоянно дующие пассаты и изменчивые по сезонам муссоны. Были открыты все острова Индийского океана. Но настоящее систематическое изучение океана, его глубин и течений, ветров и атмосферных условий, его жизни и природных богатств, началось только в XIX веке. Первые европейские мореплаватели в Индийском океане — португальцы, голландцы — держали в строгом секрете накопленные знания об условиях плавания в этом океане. Но затем времена изменились. Капитаны кораблей призывались вести систематические наблюдения над всем, что может иметь значение для безопасности кораблевождения. Результаты наблюдений над силой и направлением ветра, течениями и туманами, льдами и подводными банками собирались специальными управлениями (гидрографии, адмиралтейства) для всеобщего ознакомления. К сбору наблюдений привлекались не только торговые корабли, но и военные суда разных наций.