Через четыре года Семен Иванович был откомандирован в 55-й истребительный полк и с прибытием к месту службы был назначен адъютантом эскадрильи. Должность эта требовала всесторонней подготовки, сочетания летной работы со штабной службой. Комэску капитану Жизневскому было легко работать с Семеном Ивановичем. Хархалуп был хорошим летчиком, летал на всех типах самолетов, состоящих на вооружении, и в совершенстве владел техникой пилотирования. Был хорошо подготовлен и как штабной работник.
Семен Иванович отлично пилотировал самолет и выполнял воздушные стрельбы, умело обучал летный состав воздушному бою. При выполнении летного задания был сам предельно собран и организован и требовал этого от подчиненного летного состава, не терпел расхлябанности и нарушений дисциплины.
В его эскадрилье были летчики, которые не так давно окончили военное училище и считались молодыми, — Григорий Речкалов, Борис Комаров, Николай Яковлев, Петр Грачев, Виталий Дмитриев, Тимофей Ротанов, Георгий Кондратюк, и со всеми он летал на учебный воздушный бой, обучал умело драться и побеждать воздушного врага. Кто знает, быть может он, Семен Иванович, и заложил навыки ведения воздушного боя Григорию Речкалову, который в годы Великой Отечественной войны прославился в воздушных боях с врагом и был удостоен звания дважды Героя Советского Союза.
Возможно его, Хархалупа, выучка и закалка помогли младшему лейтенанту Николаю Яковлеву при отражении налета фашистских бомбардировщиков броситься на ведущего «хейнкеля» и сбить его, расстроить боевой порядок противника и обеспечить успех в воздушном бою своим товарищам.
Это воспитанник Семена Хархалупа младший лейтенант Петр Грачев успешно вел воздушные бои на самолете Ил-2 и смело наносил штурмовые удары по войскам и боевой технике противника; это младший лейтенант Георгий Кондратюк на «чайке» вел успешные воздушные бои с превосходящими силами врага…
С первого дня боев Семен Иванович не знал усталости и покоя, вылет за вылетом поднимаясь в воздух то на штурмовку гитлеровских войск, то на разведку, то на сопровождение бомбардировщиков. Он совершил не один десяток боевых вылетов и своими действиями нанес врагу немалые потери в живой силе и боевой технике. Его недолгая, но яркая боевая работа, его мужество, храбрость и отвага в бою служили примером для молодых летчиков. Личный состав полка с глубокой болью воспринял гибель Семена Хархалупа. Такой замечательный командир и боец, как Хархалуп, так рано — на девятый день войны — оставил поле битвы! Он многое мог бы сделать в борьбе с фашизмом и прославить русское оружие.