Из документов XVII в. создается впечатление, что продвижение на Дальний Восток шло вне зависимости от политических потрясений в Москве. Однако для хронологической стройности изложения истории освоения Сибири в этой главе приведены факты продвижения завоевателей уже после Смуты.
Освоение Енисея началось из города Мангазеи. Казаки сплавились по реке Турухан и, высадившись на берег при ее впадении в Енисей, основали в 1607 г. Туруханское зимовье, а в 1617 г. на реке Кеть построили Маковский острог. Через год станичники сына боярского Петра Альбичева и сотника Черкаса Рукина возвели Енисейский острог. К концу 1618 г. все казаки, оседавшие здесь, стали именоваться енисейскими, а с появлением городов — по их названиям. Енисейцы охраняли местных жителей и собирали с них ясак. Для этого строились новые поселения казаков — хутора Черкасы (1619), станица Мало-Белая (1620), село Абалаковское и села Мелецкого острога на Среднем Чулыме (1621). Этим создавалась база для последующей разведки мест по притокам Енисея, а также на реках Лена, Ангара и даже на озере Байкал. Весь этот огромный край тогда подчинялся воеводе Тобольска.
В 1627 г. в город Енисейск, разросшийся из одноименного острога, для управления краем отправлен воевода Я. Хрипунов, а казаки дворянина А. Дубенского поднялись вверх по реке в поисках места для строительства нового укрепления. Отряд Дубенского (304 казака на 16 судах) доплыл к устью реки Качи. Здесь у Большого порога они заложили Качинский острог, переименованный в 1628 г. в город Красноярск, ставший важным опорным пунктом среди улусов аринцев и качинцев. Вскоре хакасы-качинцы под стенами острога принесли клятву «Белому царю», а наилучшая часть их мужчин стала казаками Красноярска.
Прирост православных достигался также тем, что в Сибирь, с подавляюще мужским населением, ссылались неугодные девицы городов Руси, а крещеных хакасок выдавали замуж за казаков. В физическом типе енисейцев появились черты хакасов.
В 1628 г. из Красноярска на разведку ушли казаки атамана Ермака Евстафьева, заложившие Канский острог. Тогда же казачий десятник Василий Бугор с товарищами проложил путь к Верхней Тунгуске (Ангаре), а сын боярский Петр Бекетов с 30 казаками достиг места впадения реки Оки (сибирской) в Ангару. В 1631 г. казаки заложили Илимский острог. Тогда же полусотенный отряд томского казака Ивана Москвитина основал Братский острог, ставший своеобразным трамплином в Забайкалье.
В 1632 г. казаки заложили Якутский (Ленский) острог, имевший важное значение на северо-востоке Сибири.